233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0849 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  56.53 
 
 		 1174 aa  1181    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  55.21 
 
 		 1184 aa  1148    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  40.54 
 
 		 1231 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  100 
 
 		 1175 aa  2311    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  59.36 
 
 		 1176 aa  1187    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  35.19 
 
 		 1623 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  33.58 
 
 		 1386 aa  482  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  37.52 
 
 		 1797 aa  456  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  34.62 
 
 		 1976 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  35.83 
 
 		 1952 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  36.2 
 
 		 1836 aa  426  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  34.76 
 
 		 1955 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  36.06 
 
 		 1523 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  36.06 
 
 		 1523 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  33.88 
 
 		 1967 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  33.48 
 
 		 1980 aa  403  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  35.63 
 
 		 1529 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  37.09 
 
 		 2090 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  31.85 
 
 		 957 aa  360  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4256  TrwC relaxase  31.32 
 
 		 1026 aa  306  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  27.95 
 
 		 907 aa  181  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  29.11 
 
 		 1093 aa  171  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  35.41 
 
 		 945 aa  161  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  34.5 
 
 		 1107 aa  153  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08050  TrwC relaxase  28.61 
 
 		 1160 aa  153  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0016  TrwC relaxase  30.2 
 
 		 926 aa  151  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  35.13 
 
 		 946 aa  151  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  31.21 
 
 		 929 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  31.36 
 
 		 1102 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  31.82 
 
 		 1107 aa  150  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  33.33 
 
 		 1100 aa  150  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  28.15 
 
 		 918 aa  148  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  31.32 
 
 		 936 aa  146  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  30.92 
 
 		 1102 aa  145  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.44 
 
 		 1356 aa  145  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  28.2 
 
 		 1549 aa  145  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  34.13 
 
 		 1100 aa  144  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2022  TrwC relaxase  29.47 
 
 		 1112 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  30.35 
 
 		 1034 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  30.22 
 
 		 872 aa  142  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  27.9 
 
 		 1170 aa  142  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  33.57 
 
 		 968 aa  141  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1453  TrwC relaxase  29.06 
 
 		 1223 aa  140  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  33.16 
 
 		 1034 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  34.32 
 
 		 1006 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  30.75 
 
 		 974 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  32.74 
 
 		 1123 aa  136  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  32.13 
 
 		 976 aa  136  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  32.13 
 
 		 976 aa  136  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  32.29 
 
 		 998 aa  134  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  31.57 
 
 		 952 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  32.61 
 
 		 1000 aa  132  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  32.61 
 
 		 1000 aa  132  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  22.62 
 
 		 1112 aa  131  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  31.49 
 
 		 952 aa  131  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  28.97 
 
 		 981 aa  131  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  30.52 
 
 		 1039 aa  131  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  31.31 
 
 		 982 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  32.07 
 
 		 985 aa  125  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  27.64 
 
 		 866 aa  125  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  31.94 
 
 		 814 aa  125  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  30.42 
 
 		 998 aa  124  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  31.48 
 
 		 1025 aa  123  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.82 
 
 		 1098 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  26.72 
 
 		 1665 aa  122  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.82 
 
 		 1098 aa  121  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  29.07 
 
 		 943 aa  119  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  28.19 
 
 		 926 aa  118  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.13 
 
 		 1102 aa  118  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.79 
 
 		 1095 aa  118  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30 
 
 		 1105 aa  117  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  28.27 
 
 		 881 aa  116  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.41 
 
 		 1534 aa  115  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  29.88 
 
 		 379 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.49 
 
 		 1536 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  27.56 
 
 		 879 aa  111  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  30.71 
 
 		 1557 aa  110  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  28.17 
 
 		 982 aa  108  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  28.25 
 
 		 1035 aa  109  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0858  TrwC relaxase  31.36 
 
 		 1208 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.77 
 
 		 1245 aa  102  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.53 
 
 		 1538 aa  102  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  25.09 
 
 		 919 aa  101  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  24.7 
 
 		 1683 aa  101  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3587  exonuclease V subunit alpha  24.76 
 
 		 1699 aa  96.3  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  27.43 
 
 		 907 aa  95.9  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  35.47 
 
 		 1013 aa  94.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3619  exonuclease V subunit alpha  29.68 
 
 		 1082 aa  94.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  34.73 
 
 		 944 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  32.23 
 
 		 961 aa  92.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  22.98 
 
 		 870 aa  92.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  26.73 
 
 		 1168 aa  89.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  34.43 
 
 		 1807 aa  89.4  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  34.5 
 
 		 1014 aa  89  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  31.87 
 
 		 1486 aa  88.2  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  30.37 
 
 		 923 aa  87.4  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  35.12 
 
 		 1010 aa  87.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  26.35 
 
 		 1481 aa  85.1  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3338  hypothetical protein  39.43 
 
 		 1520 aa  84.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.389694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  31.91 
 
 		 910 aa  83.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>