223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4244 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  100 
 
 		 1168 aa  2334    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  34.25 
 
 		 952 aa  353  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  34.83 
 
 		 952 aa  351  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  33.98 
 
 		 974 aa  337  7e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  34.28 
 
 		 998 aa  335  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  35.33 
 
 		 985 aa  331  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  29.83 
 
 		 879 aa  328  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  29.58 
 
 		 881 aa  328  5e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  32.52 
 
 		 998 aa  324  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  34.41 
 
 		 976 aa  320  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  34.41 
 
 		 976 aa  320  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  33.68 
 
 		 968 aa  321  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  33.04 
 
 		 1039 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  33.85 
 
 		 814 aa  317  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  33.8 
 
 		 1025 aa  314  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  32.4 
 
 		 1034 aa  311  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  32.95 
 
 		 1034 aa  311  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  32.29 
 
 		 1006 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  32.57 
 
 		 982 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  31.73 
 
 		 1000 aa  294  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  31.73 
 
 		 1000 aa  294  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  30.69 
 
 		 1557 aa  289  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.67 
 
 		 1536 aa  288  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.57 
 
 		 1098 aa  287  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.24 
 
 		 1102 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.95 
 
 		 1105 aa  286  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.94 
 
 		 1356 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.27 
 
 		 1098 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  29.42 
 
 		 1102 aa  284  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  31.28 
 
 		 1100 aa  283  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  30.06 
 
 		 1102 aa  281  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.98 
 
 		 1095 aa  279  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  30.42 
 
 		 1107 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.72 
 
 		 1538 aa  268  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  30.04 
 
 		 1100 aa  266  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  29.59 
 
 		 1107 aa  265  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  30.12 
 
 		 1123 aa  264  8e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.62 
 
 		 1245 aa  250  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.02 
 
 		 1534 aa  249  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  29.12 
 
 		 907 aa  166  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  28.84 
 
 		 1093 aa  152  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  30.92 
 
 		 981 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  32.89 
 
 		 267 aa  122  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  33.82 
 
 		 465 aa  117  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  33.92 
 
 		 498 aa  117  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  26.3 
 
 		 918 aa  115  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  30.25 
 
 		 447 aa  112  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  35.44 
 
 		 719 aa  107  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  36.36 
 
 		 361 aa  105  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  29.74 
 
 		 544 aa  105  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  32.44 
 
 		 726 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  35.91 
 
 		 766 aa  105  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  30.67 
 
 		 730 aa  105  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  34.27 
 
 		 498 aa  104  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  26.11 
 
 		 1189 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  29.22 
 
 		 506 aa  99.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  28.81 
 
 		 501 aa  96.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0463  MobA/MobL protein  34.35 
 
 		 467 aa  87.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.0604865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  28.51 
 
 		 1481 aa  86.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  33.97 
 
 		 673 aa  84  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  31.87 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p03  hypothetical protein  35.85 
 
 		 370 aa  74.7  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  22.8 
 
 		 1170 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  26.88 
 
 		 1175 aa  74.3  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  26.48 
 
 		 872 aa  72.8  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  21.75 
 
 		 1112 aa  72  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3692  TrwC relaxase  26.25 
 
 		 1068 aa  71.6  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.372056 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.72 
 
 		 744 aa  71.2  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  24.42 
 
 		 728 aa  71.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  26.09 
 
 		 929 aa  70.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  30.34 
 
 		 160 aa  69.7  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  32.48 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  26.36 
 
 		 1176 aa  69.7  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  24.5 
 
 		 1797 aa  69.3  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  26.9 
 
 		 866 aa  69.3  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  26.51 
 
 		 1231 aa  68.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  25.6 
 
 		 2090 aa  68.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  25.33 
 
 		 926 aa  68.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  25.82 
 
 		 982 aa  67.8  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  26.24 
 
 		 1174 aa  67.4  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  25.25 
 
 		 739 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  26.76 
 
 		 907 aa  67  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  25.43 
 
 		 688 aa  67  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  25.78 
 
 		 740 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  25.07 
 
 		 744 aa  67  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1924  exodeoxyribonuclease V  25.61 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  25.73 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  26.81 
 
 		 946 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  33.12 
 
 		 944 aa  64.7  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  23.19 
 
 		 727 aa  64.3  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08050  TrwC relaxase  23.02 
 
 		 1160 aa  64.3  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  25.13 
 
 		 1184 aa  64.3  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  27.38 
 
 		 961 aa  64.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  24.62 
 
 		 1683 aa  64.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  38.39 
 
 		 310 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  25.16 
 
 		 1665 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  31.28 
 
 		 1952 aa  62  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  26.48 
 
 		 762 aa  61.6  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  30.41 
 
 		 1523 aa  61.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  25.06 
 
 		 772 aa  60.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>