198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1195 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  77.07 
 
 		 907 aa  1392    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  100 
 
 		 907 aa  1818    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  32.94 
 
 		 910 aa  322  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  29.32 
 
 		 919 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  28.57 
 
 		 870 aa  278  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  27.32 
 
 		 1665 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  26.23 
 
 		 961 aa  194  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  28.27 
 
 		 936 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  24.51 
 
 		 1170 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  25.53 
 
 		 964 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  26.97 
 
 		 929 aa  170  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  25.23 
 
 		 943 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  22.76 
 
 		 1112 aa  140  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  24.95 
 
 		 982 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1013 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  34.21 
 
 		 1756 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  27.25 
 
 		 1093 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  29.26 
 
 		 542 aa  116  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  26.11 
 
 		 1174 aa  109  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  33.97 
 
 		 1486 aa  106  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  26.37 
 
 		 923 aa  106  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  32.63 
 
 		 1807 aa  104  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  36.21 
 
 		 926 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  32.85 
 
 		 1014 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  23.99 
 
 		 907 aa  99.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  23.77 
 
 		 1351 aa  99  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  24.11 
 
 		 1035 aa  98.6  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  26.01 
 
 		 946 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  32.77 
 
 		 1986 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  32.77 
 
 		 1986 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  32.77 
 
 		 1986 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1111 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  32.77 
 
 		 1986 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  32.77 
 
 		 1986 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  32.77 
 
 		 1986 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1955 aa  94  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  25.65 
 
 		 1952 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  33.63 
 
 		 1936 aa  89.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  24.74 
 
 		 1557 aa  88.6  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  25.55 
 
 		 945 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  23.14 
 
 		 875 aa  85.5  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  25.84 
 
 		 944 aa  84.3  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  34.8 
 
 		 1010 aa  84.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  28.24 
 
 		 1175 aa  83.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  34.03 
 
 		 379 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  25.37 
 
 		 974 aa  82  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  24.36 
 
 		 952 aa  81.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  27.54 
 
 		 985 aa  81.3  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6204  conjugative relaxase domain-containing protein  33.51 
 
 		 1087 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  24.91 
 
 		 1523 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  24.91 
 
 		 1523 aa  80.5  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  22.74 
 
 		 1536 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  28.24 
 
 		 1039 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  28.03 
 
 		 1034 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  23.73 
 
 		 952 aa  77.4  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  27.33 
 
 		 976 aa  77  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  27.33 
 
 		 976 aa  77  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  24.92 
 
 		 879 aa  76.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.48 
 
 		 1538 aa  76.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  28.51 
 
 		 1797 aa  76.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  26.34 
 
 		 1386 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0027  putative protein traI  22.92 
 
 		 612 aa  73.9  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.483518  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  26.1 
 
 		 998 aa  73.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.65 
 
 		 1105 aa  73.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  27.96 
 
 		 1034 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  33.33 
 
 		 733 aa  72.8  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  32.79 
 
 		 322 aa  72.8  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.31 
 
 		 1356 aa  72.4  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  27.67 
 
 		 1836 aa  71.6  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  27.49 
 
 		 918 aa  71.6  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  29.43 
 
 		 720 aa  71.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  24 
 
 		 881 aa  70.5  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25 
 
 		 1098 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.76 
 
 		 1098 aa  70.5  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  26.76 
 
 		 998 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  35.12 
 
 		 750 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  32.19 
 
 		 731 aa  69.7  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  33.33 
 
 		 731 aa  69.7  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  25.82 
 
 		 968 aa  69.7  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.63 
 
 		 1245 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  25.76 
 
 		 1955 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  25.21 
 
 		 957 aa  68.6  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  33.33 
 
 		 744 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  28.06 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  23.21 
 
 		 1534 aa  68.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  33.82 
 
 		 728 aa  67.8  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  25.11 
 
 		 1123 aa  68.2  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  27.19 
 
 		 1100 aa  67.8  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  31.98 
 
 		 1176 aa  67  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  35.67 
 
 		 736 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  34.91 
 
 		 731 aa  67  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  26.98 
 
 		 1100 aa  66.6  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  25.45 
 
 		 982 aa  67  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.62 
 
 		 1102 aa  66.6  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  30.37 
 
 		 742 aa  65.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.28 
 
 		 1095 aa  65.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  35.53 
 
 		 740 aa  65.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0077  conjugative transfer relaxase protein TraI  30.96 
 
 		 1428 aa  65.1  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  34.52 
 
 		 728 aa  65.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  32.32 
 
 		 1006 aa  65.1  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>