284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0944 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  100 
 
 		 943 aa  1928    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  32.58 
 
 		 926 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  31.86 
 
 		 929 aa  332  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  29.86 
 
 		 961 aa  318  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  30.98 
 
 		 936 aa  296  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  29.43 
 
 		 1170 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  30.59 
 
 		 1665 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  27.99 
 
 		 964 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  29.15 
 
 		 923 aa  258  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  25.69 
 
 		 982 aa  249  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  26.22 
 
 		 1010 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  27.33 
 
 		 919 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1013 aa  221  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  25.57 
 
 		 1112 aa  220  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  25.77 
 
 		 870 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  27.25 
 
 		 910 aa  196  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  30.13 
 
 		 1035 aa  180  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  28.88 
 
 		 1486 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.41 
 
 		 1986 aa  172  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.57 
 
 		 1986 aa  170  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.57 
 
 		 1986 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.57 
 
 		 1986 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.22 
 
 		 1986 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.13 
 
 		 1986 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  25.26 
 
 		 1351 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1111 aa  162  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  28.36 
 
 		 875 aa  155  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  24.56 
 
 		 907 aa  152  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6204  conjugative relaxase domain-containing protein  31.73 
 
 		 1087 aa  151  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  25.09 
 
 		 907 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  26.27 
 
 		 1807 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  25.44 
 
 		 1014 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  27.77 
 
 		 907 aa  147  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  24.91 
 
 		 1936 aa  145  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0027  putative protein traI  27.94 
 
 		 612 aa  145  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.483518  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1955 aa  134  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  26.46 
 
 		 918 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  26.68 
 
 		 542 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  32.17 
 
 		 1756 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  27.46 
 
 		 1093 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0077  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.53 
 
 		 1428 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  25.88 
 
 		 1100 aa  116  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  25.15 
 
 		 1100 aa  111  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  25.06 
 
 		 1549 aa  103  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  24.17 
 
 		 981 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  24.44 
 
 		 1123 aa  102  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  26.34 
 
 		 957 aa  100  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  28.32 
 
 		 1175 aa  100  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  28.45 
 
 		 1797 aa  100  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.65 
 
 		 1105 aa  99.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  26.5 
 
 		 1557 aa  95.9  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  24.91 
 
 		 1481 aa  95.5  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  30.6 
 
 		 1102 aa  95.1  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  30.6 
 
 		 1102 aa  94.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  30.71 
 
 		 1107 aa  94.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  31.25 
 
 		 379 aa  93.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.16 
 
 		 1356 aa  89.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  27.7 
 
 		 945 aa  89  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  32.4 
 
 		 1107 aa  86.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  24.41 
 
 		 998 aa  85.5  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  23.72 
 
 		 968 aa  84.7  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3692  TrwC relaxase  25.25 
 
 		 1068 aa  84.3  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.372056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  27.4 
 
 		 1174 aa  84  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  27.46 
 
 		 946 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  30.11 
 
 		 686 aa  82.4  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  27.26 
 
 		 944 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  25.93 
 
 		 2090 aa  82  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  28.63 
 
 		 739 aa  81.3  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  31.11 
 
 		 1231 aa  80.9  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.67 
 
 		 1095 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.14 
 
 		 1102 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.3 
 
 		 1536 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  25.44 
 
 		 1523 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.19 
 
 		 1098 aa  78.2  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  25.44 
 
 		 1523 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  31.75 
 
 		 737 aa  77.8  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  32.05 
 
 		 985 aa  77.8  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.19 
 
 		 1098 aa  77.8  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  30.93 
 
 		 952 aa  77.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.7 
 
 		 1245 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  30.73 
 
 		 738 aa  76.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  34.36 
 
 		 742 aa  76.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  34.57 
 
 		 1006 aa  75.5  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  34.59 
 
 		 1034 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  32.04 
 
 		 1683 aa  74.3  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  33.33 
 
 		 1039 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3587  exonuclease V subunit alpha  30.94 
 
 		 1699 aa  73.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  31.25 
 
 		 952 aa  73.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  28.57 
 
 		 814 aa  73.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3226  aldehyde dehydrogenase  30.94 
 
 		 1681 aa  72  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  30.59 
 
 		 1176 aa  71.6  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  32.7 
 
 		 1034 aa  71.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  27.43 
 
 		 998 aa  71.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  28.8 
 
 		 740 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  32.08 
 
 		 976 aa  71.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  32.08 
 
 		 976 aa  71.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  24.66 
 
 		 1529 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  34.52 
 
 		 1836 aa  70.5  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  25.86 
 
 		 1955 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  27.97 
 
 		 322 aa  70.1  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>