182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_21 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  47.72 
 
 		 1986 aa  1694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  47.94 
 
 		 1986 aa  1698    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  47.72 
 
 		 1986 aa  1686    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  47.77 
 
 		 1986 aa  1689    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  100 
 
 		 1936 aa  3974    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  47.88 
 
 		 1986 aa  1694    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  47.83 
 
 		 1986 aa  1696    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1955 aa  563  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  26.88 
 
 		 1756 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  29.27 
 
 		 875 aa  300  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0077  conjugative transfer relaxase protein TraI  23.47 
 
 		 1428 aa  268  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  25.46 
 
 		 1807 aa  263  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0027  putative protein traI  29.76 
 
 		 612 aa  216  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.483518  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  27.62 
 
 		 961 aa  188  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  31.5 
 
 		 982 aa  167  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  26.74 
 
 		 926 aa  162  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  26.3 
 
 		 1486 aa  160  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1013 aa  159  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  23.13 
 
 		 929 aa  151  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  26.23 
 
 		 964 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1111 aa  149  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  26.12 
 
 		 1112 aa  147  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  32.08 
 
 		 936 aa  148  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  26.07 
 
 		 943 aa  145  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  24.72 
 
 		 1010 aa  145  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  30.53 
 
 		 1014 aa  143  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  28.17 
 
 		 1035 aa  142  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  28.32 
 
 		 923 aa  141  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  24.15 
 
 		 1170 aa  136  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  31 
 
 		 542 aa  131  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  29.48 
 
 		 1665 aa  120  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  21.87 
 
 		 919 aa  117  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  23.7 
 
 		 910 aa  112  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6204  conjugative relaxase domain-containing protein  26.55 
 
 		 1087 aa  107  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  29.27 
 
 		 907 aa  103  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  31.49 
 
 		 379 aa  101  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  33.62 
 
 		 907 aa  102  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  21 
 
 		 870 aa  90.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  33.63 
 
 		 907 aa  89.4  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.76 
 
 		 1356 aa  84.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  31.94 
 
 		 1176 aa  83.6  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  25.07 
 
 		 981 aa  84  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  29.02 
 
 		 1123 aa  83.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  29.02 
 
 		 1100 aa  82.8  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  28.63 
 
 		 1175 aa  82  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  27.12 
 
 		 1351 aa  79.7  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.72 
 
 		 1095 aa  79  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.45 
 
 		 1102 aa  79  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  30.05 
 
 		 322 aa  77.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  29.8 
 
 		 918 aa  76.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  27.35 
 
 		 1100 aa  75.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.55 
 
 		 1098 aa  73.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  23.86 
 
 		 945 aa  73.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  28.18 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  26.82 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  25.68 
 
 		 1107 aa  72  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  26.18 
 
 		 946 aa  72  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  26.96 
 
 		 350 aa  71.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  26.55 
 
 		 944 aa  71.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  25.35 
 
 		 952 aa  70.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  23.33 
 
 		 976 aa  70.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  23.33 
 
 		 976 aa  70.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  23.13 
 
 		 1093 aa  70.1  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  24.36 
 
 		 1098 aa  70.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.72 
 
 		 1105 aa  69.3  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  22.37 
 
 		 1245 aa  68.6  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  29.95 
 
 		 957 aa  68.6  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  30.81 
 
 		 1980 aa  68.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  29.52 
 
 		 2090 aa  67.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  26.58 
 
 		 348 aa  67.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  26.38 
 
 		 1102 aa  67.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  26.58 
 
 		 1102 aa  67  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  28 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  24.8 
 
 		 1107 aa  65.9  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  26.43 
 
 		 342 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  25.96 
 
 		 952 aa  65.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  31.79 
 
 		 740 aa  64.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  22.27 
 
 		 968 aa  64.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  23.01 
 
 		 974 aa  63.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  31.15 
 
 		 1231 aa  63.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  28.07 
 
 		 1557 aa  63.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  27.86 
 
 		 1174 aa  63.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  26.87 
 
 		 346 aa  61.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  27.93 
 
 		 343 aa  61.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0079  protein TraI  30.63 
 
 		 432 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.342651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  24.2 
 
 		 982 aa  61.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1405  Exodeoxyribonuclease V  30.51 
 
 		 1214 aa  60.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  28.32 
 
 		 728 aa  60.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  22.56 
 
 		 998 aa  60.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  26.56 
 
 		 1623 aa  60.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  29.89 
 
 		 1184 aa  59.3  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  28.83 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0763  helicase, putative  34.18 
 
 		 907 aa  58.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.81938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  25.89 
 
 		 345 aa  58.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0576  TrwC relaxase  28.36 
 
 		 669 aa  58.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230411  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  29.95 
 
 		 1836 aa  58.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  27.15 
 
 		 344 aa  58.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  27.15 
 
 		 344 aa  58.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  26 
 
 		 747 aa  58.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  27.35 
 
 		 346 aa  57.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>