45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0079 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0079  protein TraI  100 
 
 		 432 aa  868    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.342651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0077  conjugative transfer relaxase protein TraI  86.31 
 
 		 1428 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  96.53 
 
 		 1756 aa  848    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0076  putative type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  49.76 
 
 		 681 aa  186  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  31.72 
 
 		 1807 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1955 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  32.03 
 
 		 875 aa  66.6  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0027  putative protein traI  32.03 
 
 		 612 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.483518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  29.79 
 
 		 926 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  29.01 
 
 		 1112 aa  60.5  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  30.63 
 
 		 1936 aa  60.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0029  protein TraI  100 
 
 		 38 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2182  hypothetical protein  26.79 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  30.41 
 
 		 1035 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  31.85 
 
 		 936 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.14 
 
 		 1986 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.14 
 
 		 1986 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.43 
 
 		 1986 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.43 
 
 		 1986 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.43 
 
 		 1986 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  32.59 
 
 		 961 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  36.79 
 
 		 866 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  29.17 
 
 		 943 aa  52.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  31.71 
 
 		 1170 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.71 
 
 		 1986 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  33.04 
 
 		 1386 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  27.06 
 
 		 1486 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0858  TrwC relaxase  34.21 
 
 		 1208 aa  50.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  35 
 
 		 1010 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  32.65 
 
 		 1836 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  33.63 
 
 		 1000 aa  47.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  33.63 
 
 		 1000 aa  47.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0016  TrwC relaxase  33.33 
 
 		 926 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.82 
 
 		 1098 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  34.95 
 
 		 872 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  34.68 
 
 		 1184 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2022  TrwC relaxase  33.05 
 
 		 1112 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.93 
 
 		 1102 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  34.68 
 
 		 1174 aa  45.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.93 
 
 		 1098 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1453  TrwC relaxase  29.84 
 
 		 1223 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  25.2 
 
 		 1665 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.22 
 
 		 1095 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1111 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  24.03 
 
 		 870 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>