188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5557 on replicon NC_011730
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  100 
 
 
1170 aa  2422    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  31.78 
 
 
926 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  30.4 
 
 
961 aa  363  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  30.81 
 
 
936 aa  357  6.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  30.38 
 
 
1665 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  29.46 
 
 
964 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  29.16 
 
 
929 aa  315  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  29.68 
 
 
923 aa  305  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  29.43 
 
 
943 aa  289  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  27.81 
 
 
982 aa  264  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  26.88 
 
 
1014 aa  248  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  27.96 
 
 
1112 aa  244  6e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  25.87 
 
 
910 aa  216  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  25.87 
 
 
870 aa  214  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  25.7 
 
 
1013 aa  214  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  25.27 
 
 
1010 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  31.54 
 
 
1486 aa  202  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  25.43 
 
 
907 aa  194  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  29.37 
 
 
1035 aa  180  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  24.97 
 
 
919 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  27.97 
 
 
1807 aa  178  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  24.51 
 
 
907 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  27.96 
 
 
1093 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  23.66 
 
 
907 aa  165  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  29.28 
 
 
542 aa  164  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  27.48 
 
 
918 aa  164  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  34.32 
 
 
1111 aa  159  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  28.01 
 
 
875 aa  159  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  26.93 
 
 
1351 aa  158  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  25.91 
 
 
1955 aa  157  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  35.66 
 
 
730 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  36.08 
 
 
726 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0027  putative protein traI  27.66 
 
 
612 aa  149  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.483518  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.32 
 
 
1986 aa  141  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.66 
 
 
1986 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.86 
 
 
1986 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.86 
 
 
1986 aa  138  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.03 
 
 
1986 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.32 
 
 
1986 aa  138  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  25.7 
 
 
1174 aa  135  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  23.82 
 
 
1936 aa  134  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6204  conjugative relaxase domain-containing protein  28.13 
 
 
1087 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  25.42 
 
 
1756 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0077  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.45 
 
 
1428 aa  127  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  27.9 
 
 
1175 aa  122  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  25.87 
 
 
1836 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  31.11 
 
 
1000 aa  112  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  31.11 
 
 
1000 aa  112  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  28.39 
 
 
998 aa  112  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  29.63 
 
 
952 aa  111  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  27.48 
 
 
1039 aa  111  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  27.93 
 
 
985 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.71 
 
 
1098 aa  109  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  27.81 
 
 
998 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  28.94 
 
 
814 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  28.57 
 
 
976 aa  108  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  28.57 
 
 
976 aa  108  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  24.65 
 
 
981 aa  108  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.48 
 
 
1098 aa  106  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  26.78 
 
 
1034 aa  105  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  25.54 
 
 
1976 aa  104  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  28.98 
 
 
952 aa  104  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  27.3 
 
 
379 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  28.53 
 
 
968 aa  103  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.03 
 
 
1095 aa  102  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  25.53 
 
 
945 aa  102  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.16 
 
 
1102 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  30.8 
 
 
1107 aa  100  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  25.26 
 
 
1967 aa  100  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  29.25 
 
 
1025 aa  100  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  27.72 
 
 
982 aa  100  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  24.29 
 
 
1481 aa  99.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  25.75 
 
 
1955 aa  99  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  25.05 
 
 
944 aa  98.2  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  24.38 
 
 
1549 aa  98.2  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  26.82 
 
 
974 aa  97.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.23 
 
 
1356 aa  97.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  24.68 
 
 
1123 aa  96.3  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  25.39 
 
 
1557 aa  95.1  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  25.58 
 
 
1952 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  28.85 
 
 
1102 aa  93.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.85 
 
 
1536 aa  93.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  30.08 
 
 
1107 aa  93.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.42 
 
 
1245 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.13 
 
 
1538 aa  92.8  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  28.85 
 
 
1102 aa  92.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.85 
 
 
1105 aa  92.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  30.04 
 
 
1006 aa  91.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  29.74 
 
 
1034 aa  91.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  25.08 
 
 
1523 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  25.08 
 
 
1523 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  29.69 
 
 
1100 aa  90.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  27.92 
 
 
1100 aa  89  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.18 
 
 
1534 aa  86.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  24.14 
 
 
2090 aa  82.8  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  31.62 
 
 
1231 aa  82.8  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  30.8 
 
 
957 aa  82  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  32.88 
 
 
1184 aa  78.6  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  25.37 
 
 
881 aa  77.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  24.96 
 
 
1529 aa  77.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>