238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0763 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0999  helicase, putative  48.56 
 
 		 896 aa  835    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0763  helicase, putative  100 
 
 		 907 aa  1882    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.81938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02880  hypothetical protein  52.03 
 
 		 914 aa  946    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2644  helicase, putative  58.43 
 
 		 902 aa  1053    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0438  helicase, putative  56.56 
 
 		 914 aa  1002    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4969  helicase, putative  57.75 
 
 		 73 aa  87.4  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00955104 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  26.45 
 
 		 736 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  23.79 
 
 		 745 aa  72  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  24.89 
 
 		 736 aa  71.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  23.38 
 
 		 688 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  24.89 
 
 		 744 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  24.64 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  26.63 
 
 		 735 aa  68.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  23.86 
 
 		 735 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0455  RecD/TraA family helicase  24.61 
 
 		 731 aa  66.6  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.232252  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  24.38 
 
 		 733 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  26.5 
 
 		 731 aa  66.2  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  24.95 
 
 		 733 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  25.94 
 
 		 732 aa  65.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  25.17 
 
 		 762 aa  65.1  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  23.42 
 
 		 726 aa  63.9  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.53 
 
 		 744 aa  63.2  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  25.16 
 
 		 741 aa  63.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  25.54 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  24.77 
 
 		 653 aa  63.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  26.28 
 
 		 728 aa  63.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  24.43 
 
 		 742 aa  62.4  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  23.79 
 
 		 727 aa  62.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.33 
 
 		 576 aa  62.4  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3374  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.92 
 
 		 616 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1208  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.49 
 
 		 551 aa  62  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  25.82 
 
 		 728 aa  62  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  27.19 
 
 		 792 aa  61.6  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  24.89 
 
 		 637 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  22.33 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  24.72 
 
 		 686 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  23.37 
 
 		 728 aa  60.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  25.84 
 
 		 731 aa  60.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  21.78 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0998  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.16 
 
 		 586 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  25.48 
 
 		 724 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2294  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  39.24 
 
 		 598 aa  60.1  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1903  exodeoxyribonuclease V, 67 kDa subunit  21.73 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  23.38 
 
 		 750 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  34.18 
 
 		 1936 aa  58.9  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  26.74 
 
 		 749 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  23.94 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  23.96 
 
 		 740 aa  58.5  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  23.54 
 
 		 742 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  24.52 
 
 		 726 aa  57.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  26.3 
 
 		 747 aa  57.4  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  23.1 
 
 		 1107 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  22.75 
 
 		 1557 aa  56.6  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5462  putative deoxyribonuclease  23.94 
 
 		 368 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  24.54 
 
 		 710 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  25.06 
 
 		 768 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  24.17 
 
 		 742 aa  55.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  24.3 
 
 		 722 aa  55.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  25.63 
 
 		 733 aa  55.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  23.12 
 
 		 952 aa  55.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  23.94 
 
 		 739 aa  55.1  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0770  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  20.94 
 
 		 579 aa  55.1  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0335755  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  25.32 
 
 		 744 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_002950  PG0062  TPR domain-containing protein  23.69 
 
 		 680 aa  54.7  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  24.52 
 
 		 731 aa  54.7  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  23.91 
 
 		 731 aa  54.7  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl322  exodeoxyribonuclease V  24.76 
 
 		 743 aa  54.3  0.000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  24.69 
 
 		 738 aa  54.7  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0253  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  23.55 
 
 		 584 aa  54.3  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1075  hypothetical protein  22.79 
 
 		 439 aa  53.9  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000929546  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  30.99 
 
 		 1010 aa  54.3  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  22.89 
 
 		 1549 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  23.56 
 
 		 738 aa  53.5  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  25.91 
 
 		 737 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  23.91 
 
 		 711 aa  53.5  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  23.8 
 
 		 1095 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1779  ATPase  24.11 
 
 		 422 aa  53.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  22.65 
 
 		 926 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  25.12 
 
 		 746 aa  53.5  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  26 
 
 		 742 aa  53.5  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  22.53 
 
 		 641 aa  53.5  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5131  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  22.32 
 
 		 555 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  26.42 
 
 		 1014 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  24.22 
 
 		 825 aa  53.5  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1856  glycosysltransferase  26.51 
 
 		 438 aa  52.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  22.59 
 
 		 813 aa  52.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  23.02 
 
 		 740 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  24.03 
 
 		 724 aa  52.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0578  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.23 
 
 		 601 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1211  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  38.33 
 
 		 787 aa  52.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  23.78 
 
 		 744 aa  52.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  23.75 
 
 		 952 aa  52.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4672  putative deoxyribonuclease  24.73 
 
 		 372 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  23.57 
 
 		 985 aa  52  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0955  exodeoxyribonuclease V  24.73 
 
 		 369 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.219189 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  23.78 
 
 		 744 aa  52  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0435  AAA ATPase  25.18 
 
 		 639 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  21.81 
 
 		 772 aa  52  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2745  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.51 
 
 		 641 aa  51.6  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  23.64 
 
 		 731 aa  51.6  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>