205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7317 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  100 
 
 		 918 aa  1825    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  32.19 
 
 		 907 aa  281  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  29.75 
 
 		 1093 aa  242  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  33.01 
 
 		 952 aa  218  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  33.01 
 
 		 952 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.81 
 
 		 1098 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.19 
 
 		 1356 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.32 
 
 		 1098 aa  207  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.68 
 
 		 1102 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.34 
 
 		 1095 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  30.66 
 
 		 998 aa  196  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  29.82 
 
 		 976 aa  196  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  29.82 
 
 		 976 aa  196  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  31.29 
 
 		 974 aa  195  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  31.01 
 
 		 985 aa  195  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  29.37 
 
 		 1034 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  30.24 
 
 		 968 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  30.99 
 
 		 1100 aa  191  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  28.88 
 
 		 1039 aa  190  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  33.18 
 
 		 1123 aa  189  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  27.74 
 
 		 961 aa  188  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  31.58 
 
 		 1100 aa  187  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  30.43 
 
 		 982 aa  187  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  32.53 
 
 		 1025 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  30.1 
 
 		 1107 aa  185  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  29.39 
 
 		 1034 aa  185  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  28.53 
 
 		 964 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  32.86 
 
 		 1107 aa  183  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  30.04 
 
 		 1000 aa  181  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  30.04 
 
 		 1000 aa  181  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  31.58 
 
 		 1006 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  29.77 
 
 		 998 aa  179  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  28.54 
 
 		 981 aa  178  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  30.37 
 
 		 814 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3542  aldehyde dehydrogenase  27.83 
 
 		 1683 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311883  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  30.92 
 
 		 1102 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  25.86 
 
 		 982 aa  172  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  31.16 
 
 		 1102 aa  172  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3692  TrwC relaxase  27.4 
 
 		 1068 aa  171  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.372056 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3226  aldehyde dehydrogenase  27.46 
 
 		 1681 aa  170  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3587  exonuclease V subunit alpha  28.21 
 
 		 1699 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246341 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  27.48 
 
 		 1170 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.17 
 
 		 1105 aa  167  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  30.06 
 
 		 1557 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  28.46 
 
 		 929 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  26.57 
 
 		 881 aa  160  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  29.75 
 
 		 936 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  25.86 
 
 		 1010 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  26.27 
 
 		 879 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.8 
 
 		 1534 aa  156  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  27.47 
 
 		 926 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.69 
 
 		 1538 aa  154  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  22.38 
 
 		 1112 aa  153  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.4 
 
 		 1245 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.2 
 
 		 1536 aa  149  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  28.02 
 
 		 1175 aa  147  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  26.46 
 
 		 943 aa  142  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  29.05 
 
 		 923 aa  137  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  27.17 
 
 		 1174 aa  135  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  24.06 
 
 		 870 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  28.12 
 
 		 1836 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  27 
 
 		 1231 aa  132  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  26.6 
 
 		 919 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  26.71 
 
 		 1665 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  27.18 
 
 		 1481 aa  128  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  26.88 
 
 		 945 aa  126  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  25.12 
 
 		 1035 aa  125  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  33.66 
 
 		 379 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  27.25 
 
 		 946 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  26.91 
 
 		 944 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  26.89 
 
 		 1189 aa  118  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1111 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  27.05 
 
 		 1168 aa  115  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  34.5 
 
 		 1486 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  26.57 
 
 		 1976 aa  115  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  25.71 
 
 		 1549 aa  115  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3338  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1520 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.389694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1955 aa  114  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  34.04 
 
 		 322 aa  112  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  28.17 
 
 		 910 aa  110  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  25.65 
 
 		 1980 aa  110  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  24.45 
 
 		 957 aa  110  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1013 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2022  TrwC relaxase  26.9 
 
 		 1112 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  28.3 
 
 		 1797 aa  107  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  25.89 
 
 		 1523 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  25.89 
 
 		 1523 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  28.42 
 
 		 1967 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  30.39 
 
 		 1014 aa  102  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  29.69 
 
 		 542 aa  97.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  25.74 
 
 		 1952 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  26.08 
 
 		 1955 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  29.29 
 
 		 866 aa  96.3  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  25.64 
 
 		 1529 aa  96.3  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4256  TrwC relaxase  34.24 
 
 		 1026 aa  92.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  23.06 
 
 		 1986 aa  92  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  22.74 
 
 		 1986 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  22.74 
 
 		 1986 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  22.74 
 
 		 1986 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  22.9 
 
 		 1986 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>