216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpl0032 on replicon NC_006366
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  100 
 
 		 982 aa  2041    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  31.95 
 
 		 936 aa  366  1e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  29.31 
 
 		 1014 aa  326  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  29.19 
 
 		 961 aa  324  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  29.4 
 
 		 929 aa  323  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1013 aa  321  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  29.06 
 
 		 923 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  29.05 
 
 		 1010 aa  313  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  28.5 
 
 		 1035 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  29.24 
 
 		 926 aa  299  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  26.04 
 
 		 964 aa  270  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  28.37 
 
 		 1170 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  27.67 
 
 		 1665 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  25.79 
 
 		 943 aa  254  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1955 aa  234  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  25.67 
 
 		 1112 aa  225  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  24.81 
 
 		 870 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  38.72 
 
 		 1756 aa  198  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  26.69 
 
 		 907 aa  197  8.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  30.13 
 
 		 542 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  24.03 
 
 		 919 aa  192  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  26.16 
 
 		 1807 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  27.4 
 
 		 1093 aa  178  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1111 aa  178  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  25.86 
 
 		 918 aa  175  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.73 
 
 		 1986 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.73 
 
 		 1986 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.33 
 
 		 1986 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  35.78 
 
 		 1986 aa  167  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  31.5 
 
 		 1936 aa  167  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  35.78 
 
 		 1986 aa  167  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  35.78 
 
 		 1986 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  26.1 
 
 		 875 aa  155  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  23.12 
 
 		 910 aa  154  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0027  putative protein traI  26.09 
 
 		 612 aa  145  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.483518  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  26.02 
 
 		 1486 aa  144  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  22.87 
 
 		 1351 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  24.95 
 
 		 907 aa  130  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  24.34 
 
 		 907 aa  127  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  31.61 
 
 		 379 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  23.01 
 
 		 981 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.06 
 
 		 1356 aa  113  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6204  conjugative relaxase domain-containing protein  26.46 
 
 		 1087 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  27.83 
 
 		 1175 aa  105  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  25.66 
 
 		 1174 aa  105  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0077  conjugative transfer relaxase protein TraI  22.26 
 
 		 1428 aa  101  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.08 
 
 		 1245 aa  96.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  24.38 
 
 		 985 aa  95.5  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  24.78 
 
 		 1000 aa  92.8  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  24.78 
 
 		 1000 aa  92.8  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.44 
 
 		 1102 aa  91.3  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.03 
 
 		 1095 aa  90.1  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.8 
 
 		 1098 aa  90.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.4 
 
 		 1098 aa  89.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  33.33 
 
 		 1107 aa  89.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  29.25 
 
 		 1102 aa  89.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  23.23 
 
 		 998 aa  88.2  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  22.5 
 
 		 976 aa  87  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  22.5 
 
 		 976 aa  87  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  28.91 
 
 		 1102 aa  86.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  33.33 
 
 		 1107 aa  85.5  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  23.89 
 
 		 1039 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  24.01 
 
 		 957 aa  85.5  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  30.51 
 
 		 1123 aa  84.7  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  30.51 
 
 		 1100 aa  84.7  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  31.84 
 
 		 1176 aa  84.7  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5799  mobilization protein TraI-like protein  25.72 
 
 		 370 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  32.72 
 
 		 1100 aa  82.8  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  32.6 
 
 		 1557 aa  81.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  35.85 
 
 		 814 aa  81.6  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  24 
 
 		 1034 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  25.42 
 
 		 1034 aa  79  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.69 
 
 		 1105 aa  77.4  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.75 
 
 		 1536 aa  77.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  22.9 
 
 		 1481 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  24.15 
 
 		 1006 aa  77  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  28.81 
 
 		 952 aa  76.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  25.21 
 
 		 968 aa  77  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2182  hypothetical protein  24.88 
 
 		 261 aa  75.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  25.71 
 
 		 952 aa  75.5  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  27.37 
 
 		 982 aa  74.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  23.88 
 
 		 998 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  23.7 
 
 		 1386 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  30.12 
 
 		 1184 aa  73.6  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  25.22 
 
 		 1836 aa  72.4  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.27 
 
 		 1538 aa  72.4  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  27.57 
 
 		 728 aa  71.2  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  26.53 
 
 		 974 aa  70.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.25 
 
 		 1534 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  33.15 
 
 		 1231 aa  70.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  25.87 
 
 		 1025 aa  69.3  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  24.04 
 
 		 1529 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  28.85 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  23.29 
 
 		 879 aa  68.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  23.71 
 
 		 1523 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  25.82 
 
 		 1168 aa  68.2  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  23.71 
 
 		 1523 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  23.23 
 
 		 872 aa  67  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  21.27 
 
 		 881 aa  66.6  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  22.02 
 
 		 1549 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>