More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3229 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  100 
 
 		 637 aa  1251    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  37.5 
 
 		 730 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  31.11 
 
 		 710 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  33.49 
 
 		 741 aa  266  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 762 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  32.97 
 
 		 742 aa  260  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  33.38 
 
 		 733 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  33.38 
 
 		 733 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  33.64 
 
 		 746 aa  252  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 727 aa  250  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  32.48 
 
 		 744 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  32.92 
 
 		 731 aa  243  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  31.5 
 
 		 739 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  31.74 
 
 		 736 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  33.99 
 
 		 736 aa  242  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  33.28 
 
 		 731 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  31.73 
 
 		 728 aa  239  8e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  32.33 
 
 		 733 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  31.55 
 
 		 742 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  32.98 
 
 		 735 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  31.62 
 
 		 728 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  33.13 
 
 		 754 aa  234  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  30.59 
 
 		 738 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  31.46 
 
 		 747 aa  233  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  34.1 
 
 		 715 aa  232  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  31.06 
 
 		 731 aa  230  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  32.15 
 
 		 725 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  32.02 
 
 		 750 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  31.6 
 
 		 750 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  30.49 
 
 		 738 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  28.68 
 
 		 728 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  31.65 
 
 		 724 aa  226  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  30.88 
 
 		 738 aa  226  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  29.26 
 
 		 747 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  32.86 
 
 		 744 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  26.76 
 
 		 744 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.63 
 
 		 721 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  29.8 
 
 		 728 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  32.47 
 
 		 732 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.34 
 
 		 795 aa  219  8.999999999999998e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  30.43 
 
 		 740 aa  219  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  31.03 
 
 		 722 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  30.02 
 
 		 741 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  26.46 
 
 		 744 aa  217  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  30.06 
 
 		 711 aa  217  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  32.27 
 
 		 736 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  29.04 
 
 		 726 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  29.33 
 
 		 727 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  32.42 
 
 		 719 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0587  AAA ATPase  29.04 
 
 		 717 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  29.04 
 
 		 717 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0593  AAA ATPase  29.04 
 
 		 717 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  31.24 
 
 		 739 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  30.21 
 
 		 728 aa  213  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  29.95 
 
 		 728 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  28.92 
 
 		 740 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.73 
 
 		 825 aa  213  9e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  28.24 
 
 		 737 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  31.16 
 
 		 731 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  28.37 
 
 		 749 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  27.24 
 
 		 710 aa  211  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  31.4 
 
 		 726 aa  210  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  30.05 
 
 		 688 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  32.24 
 
 		 720 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  31.6 
 
 		 768 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  29.02 
 
 		 728 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.88 
 
 		 746 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  26.82 
 
 		 735 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  30.04 
 
 		 742 aa  204  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  28.42 
 
 		 834 aa  204  6e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  29.94 
 
 		 749 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  30.7 
 
 		 742 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  31.5 
 
 		 719 aa  200  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.54 
 
 		 833 aa  198  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  28.53 
 
 		 786 aa  196  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  25.74 
 
 		 806 aa  195  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  29.56 
 
 		 731 aa  194  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  27.59 
 
 		 778 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  29.66 
 
 		 728 aa  190  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  26.94 
 
 		 784 aa  190  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  26.09 
 
 		 742 aa  189  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  25.38 
 
 		 792 aa  187  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.77 
 
 		 744 aa  187  6e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.85 
 
 		 778 aa  187  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  26.85 
 
 		 778 aa  187  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  26.85 
 
 		 778 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  27 
 
 		 778 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  26.85 
 
 		 778 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  30.89 
 
 		 724 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  26.39 
 
 		 772 aa  184  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  26.7 
 
 		 770 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  26.92 
 
 		 778 aa  183  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  26.7 
 
 		 778 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  26.92 
 
 		 778 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  28.09 
 
 		 698 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  29.55 
 
 		 772 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.13 
 
 		 698 aa  181  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  26.94 
 
 		 740 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  26.41 
 
 		 719 aa  180  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  25.3 
 
 		 810 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>