More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3571 on replicon NC_011367
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  49.95 
 
 		 985 aa  842    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  51.93 
 
 		 952 aa  900    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  100 
 
 		 1025 aa  2017    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  49.41 
 
 		 1000 aa  804    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  49.41 
 
 		 1000 aa  804    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  49.24 
 
 		 1034 aa  854    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  46.8 
 
 		 1034 aa  793    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  48.75 
 
 		 998 aa  853    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  47.35 
 
 		 1006 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  49.1 
 
 		 1039 aa  854    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  49.62 
 
 		 974 aa  880    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  48.71 
 
 		 976 aa  822    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  48.71 
 
 		 976 aa  822    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  49.8 
 
 		 968 aa  821    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  48.75 
 
 		 982 aa  845    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  58.79 
 
 		 814 aa  786    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  52.82 
 
 		 952 aa  912    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  48.28 
 
 		 998 aa  832    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  40.21 
 
 		 1105 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  43.23 
 
 		 1102 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  43.48 
 
 		 1095 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  42.88 
 
 		 1098 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  42.62 
 
 		 1098 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  40.28 
 
 		 1102 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  40.18 
 
 		 1107 aa  513  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  39.77 
 
 		 1102 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  39.5 
 
 		 1107 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  38.73 
 
 		 1100 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  39.29 
 
 		 1123 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  38.96 
 
 		 1100 aa  492  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  40.11 
 
 		 1356 aa  472  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  40.32 
 
 		 1245 aa  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  40.48 
 
 		 1557 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  39.07 
 
 		 1536 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  40.48 
 
 		 1538 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  38.67 
 
 		 1534 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  32.82 
 
 		 881 aa  388  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  32.44 
 
 		 879 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  55.25 
 
 		 447 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  33.8 
 
 		 1168 aa  325  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  39.03 
 
 		 907 aa  273  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  38.01 
 
 		 1093 aa  253  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  52.99 
 
 		 267 aa  214  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  43.9 
 
 		 730 aa  211  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  44.4 
 
 		 719 aa  204  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  40.87 
 
 		 726 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  32.53 
 
 		 918 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  41.95 
 
 		 498 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  39.02 
 
 		 361 aa  172  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  41.92 
 
 		 465 aa  171  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  34.75 
 
 		 544 aa  170  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  40.3 
 
 		 501 aa  168  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  39.3 
 
 		 506 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5425  MobA/MobL protein  35.62 
 
 		 379 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.369959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  34.95 
 
 		 673 aa  156  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  39.33 
 
 		 498 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  35.84 
 
 		 1184 aa  146  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  34.77 
 
 		 1174 aa  142  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  34.41 
 
 		 766 aa  134  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  32.15 
 
 		 407 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  32.26 
 
 		 981 aa  126  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1355  TrwC relaxase  28.76 
 
 		 1549 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  32.71 
 
 		 1481 aa  124  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  33.18 
 
 		 1836 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8975  TrwC relaxase  30.26 
 
 		 1386 aa  119  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.582517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  33.96 
 
 		 1176 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  30.91 
 
 		 1623 aa  116  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  31.48 
 
 		 1175 aa  115  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  31.75 
 
 		 1976 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  33.25 
 
 		 1967 aa  111  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  37.71 
 
 		 310 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  29.92 
 
 		 1231 aa  111  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0463  MobA/MobL protein  39.21 
 
 		 467 aa  110  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.0604865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1469  TrwC relaxase  28.86 
 
 		 1189 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137376  normal  0.575201 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  28.82 
 
 		 1980 aa  105  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  29 
 
 		 1523 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  29 
 
 		 1523 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  29.25 
 
 		 1170 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  29.36 
 
 		 2090 aa  98.6  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  31.07 
 
 		 1797 aa  94.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_004253  pDOJH10S_p2  Mob  31.46 
 
 		 492 aa  93.6  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  27.11 
 
 		 929 aa  90.5  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.48 
 
 		 721 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  33.86 
 
 		 961 aa  89.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  23.02 
 
 		 1112 aa  89  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  32.58 
 
 		 727 aa  89  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  28.99 
 
 		 964 aa  88.2  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  39.04 
 
 		 926 aa  88.2  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011093  SeSA_C0004  43 kDa relaxation protein  32.27 
 
 		 511 aa  88.2  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  30.49 
 
 		 160 aa  87.4  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010659  SbBS512_D0003  mobilization protein A  32.33 
 
 		 516 aa  86.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.488217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  29.71 
 
 		 1955 aa  85.5  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0253  TrwC relaxase  30.87 
 
 		 957 aa  85.5  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  29.87 
 
 		 726 aa  84.7  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  24.07 
 
 		 710 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  30.69 
 
 		 872 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  31.74 
 
 		 733 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  29.93 
 
 		 866 aa  81.6  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  30.9 
 
 		 733 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  25.44 
 
 		 919 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>