65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_D28 on replicon NC_008506
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  100 
 
 		 673 aa  1387    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  46.77 
 
 		 544 aa  225  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  38.22 
 
 		 719 aa  185  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  36.9 
 
 		 730 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  37.27 
 
 		 726 aa  170  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  35.36 
 
 		 952 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  33.84 
 
 		 952 aa  153  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  32.95 
 
 		 998 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  37.01 
 
 		 1100 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  34.6 
 
 		 982 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  34.85 
 
 		 1034 aa  143  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  35.69 
 
 		 1100 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  34.95 
 
 		 1025 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  33.84 
 
 		 814 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  35.1 
 
 		 1107 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  34.65 
 
 		 465 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  35.69 
 
 		 1123 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  33.46 
 
 		 974 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.07 
 
 		 1538 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  34.06 
 
 		 501 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  33.58 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  32.97 
 
 		 1039 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  30.94 
 
 		 1102 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  33.71 
 
 		 998 aa  136  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.61 
 
 		 1356 aa  135  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.94 
 
 		 1536 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  30.31 
 
 		 1102 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  31.58 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.47 
 
 		 1534 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  32.97 
 
 		 1006 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  34.69 
 
 		 1107 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  32.82 
 
 		 1557 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  34.68 
 
 		 1034 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  33.08 
 
 		 968 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  34.07 
 
 		 361 aa  127  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  32.58 
 
 		 985 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.9 
 
 		 1245 aa  125  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  44.22 
 
 		 879 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  32.7 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  43.54 
 
 		 881 aa  123  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  31.82 
 
 		 976 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  31.82 
 
 		 976 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.51 
 
 		 1105 aa  117  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  30.8 
 
 		 1000 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  30.8 
 
 		 1000 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  31.2 
 
 		 498 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.86 
 
 		 1095 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.09 
 
 		 1098 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.45 
 
 		 1098 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.79 
 
 		 1102 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p03  hypothetical protein  30.25 
 
 		 370 aa  103  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  28.89 
 
 		 407 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0463  MobA/MobL protein  32.14 
 
 		 467 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.0604865 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  32.28 
 
 		 766 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004253  pDOJH10S_p2  Mob  29.64 
 
 		 492 aa  100  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  35.26 
 
 		 1168 aa  96.3  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  27 
 
 		 310 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  35.61 
 
 		 160 aa  80.5  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3827  MobA/MobL protein  27.73 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011093  SeSA_C0004  43 kDa relaxation protein  30.17 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  27.71 
 
 		 430 aa  67  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010659  SbBS512_D0003  mobilization protein A  29.75 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.488217  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1193  MobA/MobL protein  26.07 
 
 		 507 aa  62  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3939  MobA/MobL protein  26.48 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0900  MobA/MobL protein  26.67 
 
 		 504 aa  55.8  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>