66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1788 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  100 
 
 		 544 aa  1092    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  46.77 
 
 		 673 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  39.53 
 
 		 719 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  37.41 
 
 		 730 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  30.52 
 
 		 952 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  30.2 
 
 		 952 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  35.77 
 
 		 998 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  41.34 
 
 		 1100 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  33.46 
 
 		 498 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  35.88 
 
 		 974 aa  179  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  36.52 
 
 		 726 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  38.79 
 
 		 1123 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  38.43 
 
 		 1100 aa  177  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  37.45 
 
 		 982 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  37.07 
 
 		 814 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  37.93 
 
 		 1034 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  38.08 
 
 		 976 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  38.08 
 
 		 976 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  37.31 
 
 		 985 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  35.66 
 
 		 1102 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  36.68 
 
 		 968 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  36.9 
 
 		 1107 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  36.22 
 
 		 1102 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  35.32 
 
 		 1039 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  34.94 
 
 		 1006 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.2 
 
 		 1356 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.88 
 
 		 1105 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  36.54 
 
 		 998 aa  156  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.92 
 
 		 1536 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  34.57 
 
 		 1034 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  33.33 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  32.5 
 
 		 1000 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  32.5 
 
 		 1000 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.56 
 
 		 1538 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  34.75 
 
 		 1025 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  33.72 
 
 		 1107 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  34.26 
 
 		 1557 aa  146  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  30.45 
 
 		 407 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  36.04 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  33.78 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  28.8 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  35.11 
 
 		 766 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.03 
 
 		 1534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  32.88 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  33.48 
 
 		 881 aa  128  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.41 
 
 		 1095 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  33.49 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.41 
 
 		 1098 aa  127  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  33.03 
 
 		 879 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.14 
 
 		 1245 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.38 
 
 		 1102 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.05 
 
 		 1098 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0463  MobA/MobL protein  34.44 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.0604865 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p03  hypothetical protein  30.28 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004253  pDOJH10S_p2  Mob  29.77 
 
 		 492 aa  115  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  29.74 
 
 		 1168 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  36 
 
 		 160 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011093  SeSA_C0004  43 kDa relaxation protein  29.46 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010659  SbBS512_D0003  mobilization protein A  29.92 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.488217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  29.21 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  29.22 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1193  MobA/MobL protein  30.61 
 
 		 507 aa  67  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3827  MobA/MobL protein  26.67 
 
 		 234 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3939  MobA/MobL protein  25.95 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0900  MobA/MobL protein  27.64 
 
 		 504 aa  47.4  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0142  hypothetical protein  23.31 
 
 		 214 aa  44.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.913303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>