64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5348 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  100 
 
 		 407 aa  837    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  39.67 
 
 		 1105 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.47 
 
 		 1095 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.14 
 
 		 1102 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.1 
 
 		 1098 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.81 
 
 		 1098 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  30.45 
 
 		 544 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  38.72 
 
 		 726 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  38.72 
 
 		 766 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  32.81 
 
 		 719 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  36.9 
 
 		 361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  39.38 
 
 		 952 aa  123  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  35.08 
 
 		 730 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  31.45 
 
 		 998 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  31.06 
 
 		 1025 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  37.82 
 
 		 952 aa  119  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  35.27 
 
 		 1039 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  37.6 
 
 		 498 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  34.3 
 
 		 982 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  37.31 
 
 		 881 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  37.31 
 
 		 879 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  38.64 
 
 		 814 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  34.8 
 
 		 498 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  35.38 
 
 		 985 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  34.78 
 
 		 974 aa  112  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  34.35 
 
 		 1000 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  34.35 
 
 		 1000 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  34.19 
 
 		 1006 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  31.17 
 
 		 1034 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  32.86 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  36.52 
 
 		 976 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  36.52 
 
 		 976 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  32.08 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  32.56 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  35.8 
 
 		 998 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  34.72 
 
 		 1034 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.81 
 
 		 1356 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  29.52 
 
 		 1100 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  29.52 
 
 		 1123 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  32.09 
 
 		 501 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  30.86 
 
 		 1102 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  30.08 
 
 		 1107 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  30.47 
 
 		 1100 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  30.47 
 
 		 1102 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0463  MobA/MobL protein  33.19 
 
 		 467 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.0604865 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.72 
 
 		 1245 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  30.43 
 
 		 1107 aa  94.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  33.15 
 
 		 968 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  28.89 
 
 		 673 aa  93.2  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30 
 
 		 1536 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.37 
 
 		 1534 aa  89.7  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  29.89 
 
 		 1557 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.31 
 
 		 1538 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  31.87 
 
 		 1168 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  29.07 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  32.64 
 
 		 160 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010659  SbBS512_D0003  mobilization protein A  31.72 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.488217  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p03  hypothetical protein  27.38 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  29.94 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_011093  SeSA_C0004  43 kDa relaxation protein  30.12 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004253  pDOJH10S_p2  Mob  26.49 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1193  MobA/MobL protein  23.76 
 
 		 507 aa  50.4  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0900  MobA/MobL protein  26.5 
 
 		 504 aa  47.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2819  MobA/MobL protein  29.59 
 
 		 533 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>