57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_D2819 on replicon NC_007617
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007617  Nmul_D2819  MobA/MobL protein  100 
 
 		 533 aa  1073    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011093  SeSA_C0004  43 kDa relaxation protein  47.54 
 
 		 511 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010659  SbBS512_D0003  mobilization protein A  49.56 
 
 		 516 aa  219  7.999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.488217  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  40.66 
 
 		 766 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3827  MobA/MobL protein  40.34 
 
 		 234 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1193  MobA/MobL protein  36.36 
 
 		 507 aa  144  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0900  MobA/MobL protein  36.36 
 
 		 504 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0822  hypothetical protein  37.5 
 
 		 216 aa  114  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  36.31 
 
 		 1098 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.39 
 
 		 1102 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  32.63 
 
 		 1034 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.2 
 
 		 1095 aa  77  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  32.6 
 
 		 1025 aa  77  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.15 
 
 		 1098 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  32.35 
 
 		 968 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  30.65 
 
 		 998 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.93 
 
 		 1356 aa  73.6  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  30.8 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  35.71 
 
 		 1107 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.68 
 
 		 1534 aa  71.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  31.64 
 
 		 976 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  31.64 
 
 		 976 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  31.93 
 
 		 985 aa  68.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  34.52 
 
 		 1102 aa  68.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  31.25 
 
 		 952 aa  67  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  33.93 
 
 		 1102 aa  66.6  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  32.32 
 
 		 1107 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  33.54 
 
 		 1100 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  30.39 
 
 		 952 aa  66.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  30.34 
 
 		 1039 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  30.49 
 
 		 1557 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  31.05 
 
 		 1006 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  29.7 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  30.32 
 
 		 1034 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  33.13 
 
 		 1123 aa  63.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  33.13 
 
 		 1100 aa  63.5  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  29.83 
 
 		 814 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.74 
 
 		 1536 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  29.41 
 
 		 982 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  28.73 
 
 		 974 aa  62  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  24.91 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  29.94 
 
 		 998 aa  61.6  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  29.21 
 
 		 1000 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  29.21 
 
 		 1000 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.14 
 
 		 1538 aa  60.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  25.51 
 
 		 730 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5044  MobA/MobL protein  37.5 
 
 		 173 aa  56.6  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803549  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0463  MobA/MobL protein  32.16 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.0604865 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  30.56 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p03  hypothetical protein  28.37 
 
 		 370 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004253  pDOJH10S_p2  Mob  36.14 
 
 		 492 aa  54.7  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.18 
 
 		 1245 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.49 
 
 		 1105 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  29.24 
 
 		 498 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  27.51 
 
 		 719 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  29.59 
 
 		 407 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5045  hypothetical protein  45.45 
 
 		 78 aa  43.5  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.403262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>