67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3228 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  100 
 
 		 447 aa  897    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  80.2 
 
 		 1000 aa  607  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  80.2 
 
 		 1000 aa  607  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  76.47 
 
 		 998 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  76.18 
 
 		 1039 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  78.04 
 
 		 1034 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  76.94 
 
 		 982 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  77.54 
 
 		 976 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  77.54 
 
 		 976 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  78.07 
 
 		 998 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  78.34 
 
 		 985 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  75.46 
 
 		 1006 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  73.37 
 
 		 1034 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  72.92 
 
 		 968 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  63.75 
 
 		 952 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  63 
 
 		 952 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  65.15 
 
 		 974 aa  475  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  57.67 
 
 		 814 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  57.37 
 
 		 1025 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.51 
 
 		 1105 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.41 
 
 		 1356 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  33.26 
 
 		 1107 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  32.48 
 
 		 1102 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  32.24 
 
 		 1102 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  32.65 
 
 		 1100 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  32.88 
 
 		 1100 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  32.88 
 
 		 1123 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  44 
 
 		 719 aa  186  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  41.83 
 
 		 730 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  34.55 
 
 		 544 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.31 
 
 		 1245 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  41.83 
 
 		 726 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.44 
 
 		 1102 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  31.93 
 
 		 1107 aa  173  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  46.73 
 
 		 361 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  29.9 
 
 		 879 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35 
 
 		 1095 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  34.2 
 
 		 1098 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  29.45 
 
 		 881 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.71 
 
 		 1538 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.97 
 
 		 1098 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  30.72 
 
 		 1557 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  40.91 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.82 
 
 		 1536 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  40 
 
 		 498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  39.2 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  39.7 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  38.91 
 
 		 498 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  32.7 
 
 		 673 aa  142  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.35 
 
 		 1534 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  31.97 
 
 		 1168 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  37.5 
 
 		 766 aa  123  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  31.91 
 
 		 407 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  33.15 
 
 		 310 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_004253  pDOJH10S_p2  Mob  29.29 
 
 		 492 aa  93.2  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0463  MobA/MobL protein  35.51 
 
 		 467 aa  90.1  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121634  normal  0.0604865 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  30.43 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p03  hypothetical protein  28.81 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5322  hypothetical protein  57.89 
 
 		 97 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642861  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_010659  SbBS512_D0003  mobilization protein A  28.03 
 
 		 516 aa  73.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.488217  n/a   
 
 
-
 
NC_011093  SeSA_C0004  43 kDa relaxation protein  25.97 
 
 		 511 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3827  MobA/MobL protein  28.07 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2819  MobA/MobL protein  29.7 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3939  MobA/MobL protein  28.44 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0989  MobA/MobL protein  25.54 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1193  MobA/MobL protein  25.5 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0900  MobA/MobL protein  27.03 
 
 		 504 aa  43.5  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>