28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5322 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5322  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  200  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642861  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  60.53 
 
 		 998 aa  88.2  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  64.71 
 
 		 952 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  64.71 
 
 		 814 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  59.21 
 
 		 968 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  60.29 
 
 		 952 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  60.29 
 
 		 974 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  57.89 
 
 		 985 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  57.89 
 
 		 976 aa  80.5  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  57.89 
 
 		 976 aa  80.5  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  56.58 
 
 		 1039 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  60.29 
 
 		 1034 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  57.35 
 
 		 1034 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  57.35 
 
 		 1006 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  49.41 
 
 		 982 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  50 
 
 		 1025 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  57.89 
 
 		 447 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  58.82 
 
 		 998 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  56.58 
 
 		 1000 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  56.58 
 
 		 1000 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  45.45 
 
 		 730 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  42.42 
 
 		 506 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  42.42 
 
 		 719 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  42.42 
 
 		 726 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  38.1 
 
 		 465 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  37.88 
 
 		 501 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  48.72 
 
 		 310 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  41.46 
 
 		 544 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>