56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4107 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4107  MobA/MobL protein  100 
 
 
310 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.372473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  37.14 
 
 
814 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  35.26 
 
 
719 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  45.53 
 
 
1025 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  29.36 
 
 
952 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  35.23 
 
 
982 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  34.1 
 
 
730 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  31.32 
 
 
952 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  43.9 
 
 
974 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  43.09 
 
 
1034 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  33.33 
 
 
726 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  32.76 
 
 
506 aa  99.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  35.43 
 
 
968 aa  99.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  31.84 
 
 
998 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  33.15 
 
 
1034 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  42.28 
 
 
1006 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  29.89 
 
 
465 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  43.09 
 
 
985 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  32.76 
 
 
1039 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  37.78 
 
 
447 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  29.89 
 
 
501 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  39.55 
 
 
976 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  39.55 
 
 
976 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  33.33 
 
 
498 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  39.02 
 
 
998 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  39.34 
 
 
1000 aa  89.7  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  39.34 
 
 
1000 aa  89.7  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.13 
 
 
1536 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  30.97 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  33.33 
 
 
498 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.33 
 
 
1534 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  27 
 
 
673 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  30.22 
 
 
881 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  32.12 
 
 
879 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  30.3 
 
 
1107 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  30.12 
 
 
1557 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  29.22 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.08 
 
 
1356 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  28.64 
 
 
1123 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  27.94 
 
 
1100 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.14 
 
 
1538 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  30.3 
 
 
1100 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  28.71 
 
 
1102 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  28.22 
 
 
1102 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  29.94 
 
 
407 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  38.39 
 
 
1168 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  29.53 
 
 
1107 aa  63.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.14 
 
 
1105 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  29.91 
 
 
766 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  26.96 
 
 
1245 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.24 
 
 
1098 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.03 
 
 
1102 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  25.95 
 
 
1098 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  27.78 
 
 
1095 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  26.76 
 
 
160 aa  44.3  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004253  pDOJH10S_p2  Mob  29.41 
 
 
492 aa  43.5  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>