More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0169 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  92.04 
 
 		 879 aa  1671    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  100 
 
 		 881 aa  1820    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  31.78 
 
 		 952 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  34.28 
 
 		 952 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  33.73 
 
 		 976 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  32.87 
 
 		 1039 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  33.73 
 
 		 976 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  33.42 
 
 		 968 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  32.48 
 
 		 998 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  31.74 
 
 		 974 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  32.99 
 
 		 982 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  32.45 
 
 		 1034 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  32.65 
 
 		 1102 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  32.39 
 
 		 1102 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  33.33 
 
 		 1107 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  32.45 
 
 		 998 aa  379  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  32.42 
 
 		 1034 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  32.82 
 
 		 1025 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  33.24 
 
 		 985 aa  364  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  32.05 
 
 		 1000 aa  362  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  32.05 
 
 		 1000 aa  362  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.58 
 
 		 1095 aa  362  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  32.2 
 
 		 1006 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.65 
 
 		 1105 aa  358  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  31.78 
 
 		 814 aa  356  8.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  31.69 
 
 		 1100 aa  356  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  32.66 
 
 		 1356 aa  353  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.3 
 
 		 1098 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.25 
 
 		 1098 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  31.44 
 
 		 1107 aa  348  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.99 
 
 		 1102 aa  344  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  30.45 
 
 		 1557 aa  337  5e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  31.02 
 
 		 1100 aa  337  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  31.19 
 
 		 1123 aa  330  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  29.58 
 
 		 1168 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.4 
 
 		 1536 aa  317  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.25 
 
 		 1245 aa  317  7e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.71 
 
 		 1538 aa  300  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.74 
 
 		 1534 aa  293  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  31.98 
 
 		 907 aa  243  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  32.44 
 
 		 1093 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  26.57 
 
 		 918 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  28.39 
 
 		 447 aa  144  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  44.87 
 
 		 361 aa  138  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  40.11 
 
 		 498 aa  135  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  39.23 
 
 		 726 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  36.73 
 
 		 730 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  33.48 
 
 		 544 aa  128  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  33.78 
 
 		 267 aa  127  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  39.01 
 
 		 719 aa  127  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  25.48 
 
 		 981 aa  125  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  26.87 
 
 		 710 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.1 
 
 		 721 aa  122  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  26.59 
 
 		 2090 aa  117  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  37.31 
 
 		 407 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  35.05 
 
 		 465 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  29.21 
 
 		 1184 aa  114  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  29.18 
 
 		 1174 aa  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  43.54 
 
 		 673 aa  113  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  27.39 
 
 		 1967 aa  112  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  26.25 
 
 		 1797 aa  110  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  24.77 
 
 		 1955 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  28.27 
 
 		 1175 aa  107  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  26.65 
 
 		 637 aa  107  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  26.58 
 
 		 1952 aa  106  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  29.04 
 
 		 717 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0587  AAA ATPase  29.04 
 
 		 717 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0593  AAA ATPase  29.04 
 
 		 717 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  26.09 
 
 		 1523 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  26.09 
 
 		 1523 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  27.42 
 
 		 872 aa  105  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  33.7 
 
 		 501 aa  104  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  26.35 
 
 		 1976 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  33.7 
 
 		 506 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  24.03 
 
 		 1836 aa  102  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  24.18 
 
 		 1623 aa  102  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  37.16 
 
 		 498 aa  101  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  26.23 
 
 		 1980 aa  100  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  26.69 
 
 		 866 aa  99.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  25.19 
 
 		 1481 aa  97.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  26.91 
 
 		 659 aa  96.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  95.9  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  27.64 
 
 		 747 aa  94.7  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  26.11 
 
 		 1176 aa  93.6  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  26.11 
 
 		 736 aa  92.8  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  28.57 
 
 		 744 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  27.95 
 
 		 1231 aa  92  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  24.16 
 
 		 1665 aa  92.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  37.36 
 
 		 766 aa  92.4  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  26.57 
 
 		 776 aa  91.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  27.72 
 
 		 641 aa  90.9  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  26.6 
 
 		 735 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  23.13 
 
 		 711 aa  89.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  25.99 
 
 		 738 aa  89  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  29.23 
 
 		 745 aa  87.8  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  26.2 
 
 		 741 aa  87.4  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  25.4 
 
 		 742 aa  87.4  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  25.36 
 
 		 1529 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1208  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.45 
 
 		 551 aa  86.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  25.46 
 
 		 744 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>