More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2658 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  100 
 
 		 659 aa  1275    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  57.95 
 
 		 653 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  54.42 
 
 		 776 aa  566  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2646  exodeoxyribonuclease V  67.77 
 
 		 816 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.215439  normal  0.0562763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2280  helicase, RecD/TraA family  46.96 
 
 		 580 aa  317  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  35.82 
 
 		 733 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  35.68 
 
 		 733 aa  291  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  32.75 
 
 		 728 aa  289  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 747 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  36.45 
 
 		 736 aa  286  7e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  33.48 
 
 		 728 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  33.53 
 
 		 750 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  34.15 
 
 		 744 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  36.3 
 
 		 750 aa  283  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  36.77 
 
 		 744 aa  283  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  36.07 
 
 		 740 aa  283  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  34.8 
 
 		 742 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  31.49 
 
 		 738 aa  280  7e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  35.48 
 
 		 725 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  34.95 
 
 		 741 aa  277  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  31.91 
 
 		 737 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  34.64 
 
 		 727 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  34.59 
 
 		 731 aa  275  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  32.35 
 
 		 740 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  33.14 
 
 		 740 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  36.99 
 
 		 735 aa  273  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  35.94 
 
 		 746 aa  273  9e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  32.54 
 
 		 749 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1840  hypothetical protein  40.98 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  33.23 
 
 		 728 aa  271  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  31.71 
 
 		 731 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  36.18 
 
 		 742 aa  270  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  36.2 
 
 		 736 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  31.61 
 
 		 735 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  36.04 
 
 		 739 aa  269  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  35.63 
 
 		 762 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  34.49 
 
 		 731 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  34.29 
 
 		 722 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  35.96 
 
 		 754 aa  266  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  34.59 
 
 		 749 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  32.1 
 
 		 728 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  33.13 
 
 		 688 aa  265  2e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  43.58 
 
 		 720 aa  264  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  32.93 
 
 		 733 aa  264  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  30.19 
 
 		 727 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  33.38 
 
 		 728 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  32.74 
 
 		 738 aa  262  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  36.86 
 
 		 724 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  34.63 
 
 		 738 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  35.99 
 
 		 736 aa  261  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  34.94 
 
 		 724 aa  259  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  35.96 
 
 		 715 aa  256  9e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  34.87 
 
 		 719 aa  256  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  31.5 
 
 		 728 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  33.88 
 
 		 726 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  32.38 
 
 		 739 aa  252  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.69 
 
 		 746 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  29.05 
 
 		 710 aa  251  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  28.87 
 
 		 726 aa  250  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  29.59 
 
 		 741 aa  249  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.46 
 
 		 744 aa  249  1e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  33.23 
 
 		 732 aa  249  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  33.18 
 
 		 719 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  30.56 
 
 		 711 aa  248  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  32.68 
 
 		 731 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  32.89 
 
 		 731 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  32.81 
 
 		 728 aa  241  5e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  40.98 
 
 		 768 aa  240  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  30.85 
 
 		 742 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  39.24 
 
 		 732 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  32.63 
 
 		 742 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  32.79 
 
 		 698 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  30.03 
 
 		 742 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  28.29 
 
 		 770 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  28.29 
 
 		 778 aa  233  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  32.42 
 
 		 698 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  27.78 
 
 		 778 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  31.79 
 
 		 728 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.78 
 
 		 778 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  31.73 
 
 		 871 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  27.78 
 
 		 778 aa  232  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  27.39 
 
 		 772 aa  232  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.64 
 
 		 778 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  27.64 
 
 		 778 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  27.78 
 
 		 778 aa  231  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  27.92 
 
 		 778 aa  231  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  30.78 
 
 		 786 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  28.81 
 
 		 719 aa  228  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  31.53 
 
 		 795 aa  228  4e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  29.55 
 
 		 784 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  27.81 
 
 		 778 aa  226  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  34.99 
 
 		 726 aa  221  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  26.26 
 
 		 813 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  40.76 
 
 		 641 aa  218  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  33.04 
 
 		 772 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1106  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30.4 
 
 		 766 aa  212  1e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.710549  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  26.26 
 
 		 744 aa  210  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  27.38 
 
 		 825 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2765  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member  46.69 
 
 		 696 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  29.54 
 
 		 740 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>