More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2772 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  100 
 
 		 653 aa  1270    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  57.91 
 
 		 659 aa  646    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  61.86 
 
 		 776 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2646  exodeoxyribonuclease V  61.19 
 
 		 816 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.215439  normal  0.0562763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2280  helicase, RecD/TraA family  45.11 
 
 		 580 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  35.52 
 
 		 736 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  34.96 
 
 		 750 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  34.76 
 
 		 738 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  35.19 
 
 		 725 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  34.64 
 
 		 746 aa  279  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  35.17 
 
 		 762 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  32.21 
 
 		 738 aa  279  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  31.62 
 
 		 740 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  34.66 
 
 		 744 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  34.91 
 
 		 741 aa  275  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  33.33 
 
 		 742 aa  270  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  34.65 
 
 		 742 aa  269  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  34.88 
 
 		 733 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  36.07 
 
 		 754 aa  269  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  33.08 
 
 		 728 aa  269  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  31.75 
 
 		 728 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  35.5 
 
 		 731 aa  267  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  34.78 
 
 		 733 aa  266  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  31.13 
 
 		 737 aa  266  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  35.25 
 
 		 731 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  31.33 
 
 		 739 aa  263  6e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  35.11 
 
 		 739 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  36.21 
 
 		 735 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  33.18 
 
 		 749 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  32.73 
 
 		 744 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  34.41 
 
 		 728 aa  261  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  34.57 
 
 		 727 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  35.88 
 
 		 736 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  31.52 
 
 		 731 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  32.46 
 
 		 728 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  35.67 
 
 		 740 aa  257  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  29.8 
 
 		 747 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  36.41 
 
 		 720 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  37.8 
 
 		 736 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  31.55 
 
 		 728 aa  253  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  31.67 
 
 		 749 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  32.87 
 
 		 722 aa  251  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  30.59 
 
 		 727 aa  249  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  32.36 
 
 		 733 aa  247  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  31.55 
 
 		 740 aa  246  9e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  32.28 
 
 		 738 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  30.9 
 
 		 728 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  31.49 
 
 		 750 aa  244  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  32.63 
 
 		 768 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  32.04 
 
 		 726 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  35.69 
 
 		 724 aa  240  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1840  hypothetical protein  37.65 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  27.4 
 
 		 710 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.64 
 
 		 744 aa  238  3e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  32.46 
 
 		 731 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30.16 
 
 		 746 aa  238  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  32.56 
 
 		 731 aa  237  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  31.37 
 
 		 795 aa  237  6e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  34.29 
 
 		 732 aa  234  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  30.76 
 
 		 732 aa  233  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  28.34 
 
 		 735 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  32.53 
 
 		 728 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  34.96 
 
 		 724 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  31.63 
 
 		 740 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  32.42 
 
 		 742 aa  227  7e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  29.19 
 
 		 741 aa  226  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  30.2 
 
 		 825 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  30.2 
 
 		 825 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  30.61 
 
 		 719 aa  219  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  28.5 
 
 		 742 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  27.38 
 
 		 726 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  32.69 
 
 		 711 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  32.54 
 
 		 719 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  29.74 
 
 		 810 aa  216  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  31.82 
 
 		 698 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  29.75 
 
 		 688 aa  213  9e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  31.43 
 
 		 698 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  28.57 
 
 		 786 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  31.6 
 
 		 715 aa  209  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  30.16 
 
 		 778 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  32.37 
 
 		 813 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2765  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member  45.85 
 
 		 696 aa  208  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  29.78 
 
 		 778 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  26.54 
 
 		 772 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  28.08 
 
 		 784 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  29.64 
 
 		 778 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  29.64 
 
 		 770 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  29.78 
 
 		 778 aa  207  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.64 
 
 		 778 aa  207  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  29.78 
 
 		 778 aa  207  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.64 
 
 		 778 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  29.64 
 
 		 778 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  29.81 
 
 		 778 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  35.69 
 
 		 726 aa  206  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  28.13 
 
 		 792 aa  205  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  30.02 
 
 		 728 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  30.77 
 
 		 742 aa  204  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  30.74 
 
 		 772 aa  203  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  29.97 
 
 		 806 aa  201  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  34.91 
 
 		 871 aa  201  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>