136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2280 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2280  helicase, RecD/TraA family  100 
 
 		 580 aa  1084    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  47.46 
 
 		 659 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  45.5 
 
 		 653 aa  345  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1840  hypothetical protein  42.25 
 
 		 581 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  46.96 
 
 		 776 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2646  exodeoxyribonuclease V  49.87 
 
 		 816 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.215439  normal  0.0562763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2765  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member  47.47 
 
 		 696 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  28.38 
 
 		 728 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  28.05 
 
 		 728 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  27.57 
 
 		 728 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  28.41 
 
 		 738 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  28.36 
 
 		 733 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  29.95 
 
 		 731 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  29.33 
 
 		 749 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  28.33 
 
 		 727 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  27.15 
 
 		 731 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  24.23 
 
 		 742 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  27.9 
 
 		 728 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  29.59 
 
 		 731 aa  133  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  27.82 
 
 		 728 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  33.57 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  33.57 
 
 		 733 aa  131  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  28.4 
 
 		 731 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  28.52 
 
 		 722 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  29.06 
 
 		 719 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  27.54 
 
 		 749 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  31.26 
 
 		 735 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  33.57 
 
 		 727 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  27.77 
 
 		 747 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  27.23 
 
 		 732 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  28.76 
 
 		 737 aa  127  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  26.94 
 
 		 740 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  31.17 
 
 		 736 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  35.18 
 
 		 720 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  30.24 
 
 		 738 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  28.74 
 
 		 740 aa  124  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  29.59 
 
 		 738 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4795  hypothetical protein  47 
 
 		 630 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  28.93 
 
 		 728 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  23.77 
 
 		 735 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  27.32 
 
 		 728 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  29.95 
 
 		 744 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  31.1 
 
 		 736 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  24.25 
 
 		 726 aa  120  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  29.71 
 
 		 746 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  29.52 
 
 		 750 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  28.76 
 
 		 742 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  24.13 
 
 		 710 aa  118  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  27.83 
 
 		 739 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  28.74 
 
 		 750 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  29.97 
 
 		 725 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  29.88 
 
 		 724 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  26.8 
 
 		 726 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  29.44 
 
 		 744 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  27.88 
 
 		 728 aa  112  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  27.74 
 
 		 731 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  23.45 
 
 		 746 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.78 
 
 		 744 aa  108  2e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  28.36 
 
 		 736 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  28.19 
 
 		 732 aa  108  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  27.93 
 
 		 741 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  27.45 
 
 		 724 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  28.72 
 
 		 719 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  28.76 
 
 		 768 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  26.58 
 
 		 742 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  34.21 
 
 		 715 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  30.47 
 
 		 754 aa  105  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  24.89 
 
 		 741 aa  104  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  29.55 
 
 		 739 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  28.57 
 
 		 742 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  32.92 
 
 		 762 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1167  hypothetical protein  34.14 
 
 		 383 aa  100  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  27.98 
 
 		 711 aa  100  9e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  22.8 
 
 		 795 aa  98.2  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  20.48 
 
 		 744 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  23 
 
 		 834 aa  96.7  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1106  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  22.3 
 
 		 766 aa  95.1  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.710549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  25.78 
 
 		 688 aa  95.1  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  20.48 
 
 		 744 aa  94.4  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  22.54 
 
 		 806 aa  93.6  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  21.75 
 
 		 719 aa  90.9  6e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  21.78 
 
 		 772 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  28.24 
 
 		 740 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  27.77 
 
 		 871 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  26.98 
 
 		 786 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  31.39 
 
 		 641 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  21.68 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  21.51 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  21.51 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  21.68 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  21.68 
 
 		 770 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  22.77 
 
 		 792 aa  80.9  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  21.68 
 
 		 778 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  24.93 
 
 		 784 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  25.33 
 
 		 742 aa  80.5  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  21.68 
 
 		 778 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  23.72 
 
 		 825 aa  80.1  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  21.68 
 
 		 778 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  23.72 
 
 		 825 aa  80.1  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  21.85 
 
 		 778 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>