More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4895 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  100 
 
 
776 aa  1475    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  54.42 
 
 
659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2646  exodeoxyribonuclease V  81.64 
 
 
816 aa  544  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.215439  normal  0.0562763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  45.48 
 
 
653 aa  445  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  34.55 
 
 
750 aa  268  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  36.11 
 
 
762 aa  264  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  42 
 
 
733 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  42 
 
 
733 aa  261  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  42.42 
 
 
728 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  44.9 
 
 
741 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  40.15 
 
 
740 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  45.29 
 
 
742 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  40.82 
 
 
750 aa  252  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  40.81 
 
 
744 aa  252  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  46.31 
 
 
738 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  43.9 
 
 
742 aa  250  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  44.36 
 
 
720 aa  250  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  42.28 
 
 
727 aa  250  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  32.79 
 
 
736 aa  248  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  45.5 
 
 
746 aa  248  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  45.32 
 
 
754 aa  247  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  44.9 
 
 
725 aa  246  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  39.45 
 
 
740 aa  247  8e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  39.66 
 
 
739 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  39.36 
 
 
733 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  41.49 
 
 
731 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  40.21 
 
 
728 aa  246  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  37.44 
 
 
728 aa  244  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  39.24 
 
 
738 aa  243  7e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  44.76 
 
 
744 aa  243  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  44.47 
 
 
739 aa  243  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  40.05 
 
 
711 aa  243  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  41.2 
 
 
731 aa  242  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  42.54 
 
 
736 aa  241  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2280  helicase, RecD/TraA family  51.44 
 
 
580 aa  241  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00139258  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  27.46 
 
 
834 aa  241  5e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  41.42 
 
 
735 aa  240  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  39.22 
 
 
688 aa  239  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  38.1 
 
 
738 aa  239  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  42.82 
 
 
768 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  34.7 
 
 
744 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  37.66 
 
 
737 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  38.44 
 
 
749 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  38.62 
 
 
747 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  34.65 
 
 
806 aa  232  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  38.56 
 
 
728 aa  231  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  44.23 
 
 
724 aa  230  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  39.12 
 
 
749 aa  231  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  41.62 
 
 
736 aa  230  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  37.47 
 
 
698 aa  230  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  37.53 
 
 
698 aa  230  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  35.61 
 
 
710 aa  229  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  36.55 
 
 
731 aa  229  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  41.89 
 
 
740 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  37.34 
 
 
732 aa  227  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  39.62 
 
 
786 aa  226  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  37.87 
 
 
728 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  39.34 
 
 
871 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  35.28 
 
 
740 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  34.71 
 
 
741 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  37.96 
 
 
784 aa  224  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  40.15 
 
 
724 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  37.07 
 
 
746 aa  222  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  40.55 
 
 
732 aa  221  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  38.81 
 
 
742 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  37.31 
 
 
728 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  36.99 
 
 
742 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  39.27 
 
 
719 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  36.72 
 
 
735 aa  218  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  39.69 
 
 
726 aa  218  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  39.21 
 
 
722 aa  218  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  39.28 
 
 
731 aa  217  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  42.5 
 
 
715 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  35.71 
 
 
772 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  34.63 
 
 
727 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  40.28 
 
 
728 aa  214  7e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  40.66 
 
 
719 aa  213  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  39.18 
 
 
731 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  35 
 
 
778 aa  212  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  38.35 
 
 
772 aa  212  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  35 
 
 
778 aa  212  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  36.5 
 
 
778 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  35 
 
 
778 aa  211  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.5 
 
 
778 aa  211  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  36.5 
 
 
778 aa  211  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  36.5 
 
 
770 aa  211  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  36.5 
 
 
778 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  35 
 
 
778 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  37.08 
 
 
742 aa  211  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  39.9 
 
 
728 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  36.2 
 
 
778 aa  209  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.97 
 
 
825 aa  205  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  39.73 
 
 
641 aa  203  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  41.52 
 
 
726 aa  203  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2765  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit - helicase superfamily I member  48.16 
 
 
696 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0140893  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  33.92 
 
 
726 aa  200  7e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  34.13 
 
 
825 aa  200  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  34.13 
 
 
825 aa  200  9e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  34.94 
 
 
795 aa  200  9e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  30.36 
 
 
813 aa  198  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>