More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3656 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  100 
 
 		 641 aa  1263    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  41.71 
 
 		 659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  32.03 
 
 		 738 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  39.95 
 
 		 742 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  39.08 
 
 		 742 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  31.93 
 
 		 741 aa  220  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  39.95 
 
 		 744 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  37.87 
 
 		 736 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  35.16 
 
 		 726 aa  216  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  39.84 
 
 		 725 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  37.28 
 
 		 762 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  31.34 
 
 		 754 aa  213  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  38.17 
 
 		 750 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  39.1 
 
 		 746 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  38.99 
 
 		 738 aa  210  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  37.81 
 
 		 720 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  27.31 
 
 		 728 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  35.53 
 
 		 784 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  28.2 
 
 		 737 aa  206  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  28.9 
 
 		 740 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  29.35 
 
 		 738 aa  204  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  37.17 
 
 		 739 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  35.53 
 
 		 786 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  27.78 
 
 		 728 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  31.91 
 
 		 728 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  37.41 
 
 		 740 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  29.31 
 
 		 731 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  38.11 
 
 		 739 aa  201  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  32.6 
 
 		 768 aa  200  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  28.55 
 
 		 740 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  27.55 
 
 		 726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  39.58 
 
 		 776 aa  198  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  28.14 
 
 		 728 aa  198  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  29.92 
 
 		 735 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  29.27 
 
 		 688 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  35.04 
 
 		 733 aa  197  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  28.63 
 
 		 728 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  35.04 
 
 		 733 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  34.29 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  36.94 
 
 		 653 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  35.62 
 
 		 744 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5408  helicase, RecD/TraA family  35.48 
 
 		 741 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.68949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  36.07 
 
 		 733 aa  194  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  35.58 
 
 		 727 aa  193  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  30.16 
 
 		 736 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  26.62 
 
 		 834 aa  192  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  36.93 
 
 		 740 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  30.43 
 
 		 711 aa  192  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  35.17 
 
 		 750 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  35.42 
 
 		 698 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  28.12 
 
 		 749 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  35.93 
 
 		 747 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  35.96 
 
 		 698 aa  190  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  34.86 
 
 		 731 aa  190  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.62 
 
 		 744 aa  189  1e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  29.59 
 
 		 715 aa  188  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  34.09 
 
 		 833 aa  188  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  37.09 
 
 		 719 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  34.59 
 
 		 731 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  32.85 
 
 		 772 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2646  exodeoxyribonuclease V  39.78 
 
 		 816 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.215439  normal  0.0562763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  32.47 
 
 		 778 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  26.84 
 
 		 806 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  32.76 
 
 		 778 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  32.47 
 
 		 778 aa  183  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  33.52 
 
 		 770 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  33.52 
 
 		 778 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  32.05 
 
 		 742 aa  183  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  33.52 
 
 		 778 aa  183  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.52 
 
 		 778 aa  183  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  29.13 
 
 		 724 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.52 
 
 		 778 aa  183  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  32.35 
 
 		 727 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  33.52 
 
 		 778 aa  183  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  33.52 
 
 		 778 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  34.62 
 
 		 736 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  25.73 
 
 		 744 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  25.74 
 
 		 744 aa  178  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  32.85 
 
 		 825 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  27.4 
 
 		 719 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  30 
 
 		 728 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  29.78 
 
 		 732 aa  174  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  37.04 
 
 		 724 aa  174  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.25 
 
 		 795 aa  173  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  33.61 
 
 		 731 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  25.21 
 
 		 719 aa  172  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  30.56 
 
 		 735 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  31.21 
 
 		 825 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  31.21 
 
 		 825 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  33.61 
 
 		 726 aa  171  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  35.49 
 
 		 871 aa  170  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  26.14 
 
 		 742 aa  168  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  33.82 
 
 		 732 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  30.92 
 
 		 810 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  27.89 
 
 		 686 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  25.34 
 
 		 741 aa  161  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  26.98 
 
 		 722 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.09 
 
 		 746 aa  160  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0455  RecD/TraA family helicase  25.48 
 
 		 731 aa  159  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.232252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  28.97 
 
 		 710 aa  158  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>