More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0826 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  100 
 
 
726 aa  1437    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  36.18 
 
 
747 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  35.32 
 
 
728 aa  349  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  34.78 
 
 
740 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  36.02 
 
 
739 aa  342  2e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  33.43 
 
 
731 aa  340  4e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  33.88 
 
 
749 aa  339  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  36.31 
 
 
728 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  34.72 
 
 
738 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  34.44 
 
 
728 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  34.32 
 
 
728 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  36.07 
 
 
733 aa  333  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  36.01 
 
 
733 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  35.3 
 
 
750 aa  332  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  34.07 
 
 
740 aa  328  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  35.46 
 
 
724 aa  327  7e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  35.69 
 
 
727 aa  326  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  36.18 
 
 
736 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  36.14 
 
 
728 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  34.99 
 
 
744 aa  321  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  34.83 
 
 
737 aa  320  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  36.02 
 
 
738 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  36.29 
 
 
739 aa  319  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  35.55 
 
 
736 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  34.71 
 
 
738 aa  318  2e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  35.41 
 
 
688 aa  317  5e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  36.33 
 
 
741 aa  317  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  37.19 
 
 
742 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  34.63 
 
 
726 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  35.44 
 
 
762 aa  313  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  35.29 
 
 
750 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  36.48 
 
 
725 aa  312  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  34.34 
 
 
731 aa  312  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  33.99 
 
 
731 aa  312  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  34.76 
 
 
731 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  35.17 
 
 
746 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  34.13 
 
 
731 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  34.3 
 
 
722 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  35.24 
 
 
742 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  31.68 
 
 
710 aa  308  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  35.08 
 
 
732 aa  306  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  36.35 
 
 
719 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  35.53 
 
 
744 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  36.53 
 
 
736 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  36.56 
 
 
735 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  33.56 
 
 
726 aa  301  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  32.51 
 
 
733 aa  300  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  30.88 
 
 
735 aa  300  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  33.15 
 
 
728 aa  299  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  37.55 
 
 
724 aa  299  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  32.79 
 
 
728 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  35.35 
 
 
715 aa  298  3e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  34.97 
 
 
719 aa  296  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  35.08 
 
 
768 aa  293  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  31.63 
 
 
742 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  31.2 
 
 
727 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  29.03 
 
 
719 aa  286  7e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  31.38 
 
 
744 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  33.06 
 
 
749 aa  283  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  29.99 
 
 
741 aa  280  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  34.69 
 
 
754 aa  278  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  33.15 
 
 
728 aa  278  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  32.55 
 
 
742 aa  275  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  33.56 
 
 
786 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  33.56 
 
 
742 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30.42 
 
 
746 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  33.08 
 
 
711 aa  269  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  32.07 
 
 
871 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  34.87 
 
 
720 aa  267  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  31.6 
 
 
732 aa  264  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  31.53 
 
 
740 aa  264  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  28.92 
 
 
744 aa  264  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  28.92 
 
 
744 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  32.59 
 
 
698 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  32.88 
 
 
698 aa  260  7e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  28.74 
 
 
784 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  30.09 
 
 
778 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  30.09 
 
 
770 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  33.96 
 
 
740 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  30.09 
 
 
778 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  31.51 
 
 
772 aa  258  4e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.96 
 
 
778 aa  257  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  30.23 
 
 
778 aa  257  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.96 
 
 
778 aa  256  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  29.96 
 
 
778 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  29.96 
 
 
778 aa  256  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  30.23 
 
 
778 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  27.18 
 
 
834 aa  254  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  30.36 
 
 
778 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  30.03 
 
 
772 aa  252  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30.63 
 
 
825 aa  249  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30.08 
 
 
795 aa  241  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  27.73 
 
 
806 aa  238  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.68 
 
 
833 aa  234  5e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  34.99 
 
 
659 aa  230  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  28.17 
 
 
825 aa  229  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  28.17 
 
 
825 aa  229  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  28.42 
 
 
810 aa  227  7e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5408  helicase, RecD/TraA family  31.7 
 
 
741 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.68949  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  26.06 
 
 
813 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>