More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5408 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5408  helicase, RecD/TraA family  100 
 
 
741 aa  1457    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.68949  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  37.79 
 
 
736 aa  392  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  37.07 
 
 
725 aa  372  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  36.4 
 
 
741 aa  369  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  35.96 
 
 
738 aa  365  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  36.13 
 
 
762 aa  363  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  35.49 
 
 
746 aa  363  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  36.14 
 
 
744 aa  363  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  34.91 
 
 
742 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  35.44 
 
 
750 aa  357  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  33.02 
 
 
710 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  36.38 
 
 
742 aa  356  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  35.7 
 
 
754 aa  347  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  34.2 
 
 
728 aa  346  8e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  35.42 
 
 
732 aa  343  5.999999999999999e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  35.38 
 
 
739 aa  342  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  34.88 
 
 
728 aa  339  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  34.78 
 
 
750 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  34.84 
 
 
728 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  34.62 
 
 
738 aa  336  9e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  36.68 
 
 
768 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  32.55 
 
 
728 aa  333  9e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  36.68 
 
 
731 aa  333  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  34.52 
 
 
744 aa  331  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  36.03 
 
 
719 aa  331  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  36.45 
 
 
731 aa  329  9e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  34.14 
 
 
749 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  32.64 
 
 
727 aa  327  7e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  34.49 
 
 
733 aa  325  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  33.2 
 
 
731 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  33.82 
 
 
724 aa  324  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  33.75 
 
 
731 aa  323  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  32.21 
 
 
726 aa  316  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  34.49 
 
 
735 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  31.61 
 
 
735 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  34.55 
 
 
733 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  34.89 
 
 
736 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  32.56 
 
 
732 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  33.33 
 
 
722 aa  312  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  32.88 
 
 
728 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  32.84 
 
 
738 aa  312  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  34.55 
 
 
733 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  31.03 
 
 
746 aa  311  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  33.75 
 
 
728 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  32.24 
 
 
737 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  32.92 
 
 
740 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  34.5 
 
 
727 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  32.55 
 
 
728 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  30.65 
 
 
749 aa  303  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  33.79 
 
 
728 aa  302  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  31.12 
 
 
740 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  29.92 
 
 
747 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  32.96 
 
 
742 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  30.25 
 
 
742 aa  298  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.72 
 
 
744 aa  296  8e-79  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  33.74 
 
 
740 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  29.52 
 
 
744 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  29.6 
 
 
744 aa  292  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  34.98 
 
 
724 aa  291  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  32.16 
 
 
739 aa  286  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  28.59 
 
 
719 aa  281  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  33.66 
 
 
736 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  28.82 
 
 
741 aa  272  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  31.91 
 
 
726 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  31.91 
 
 
731 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  34.2 
 
 
715 aa  265  3e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  32.29 
 
 
719 aa  263  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  33.9 
 
 
720 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  30.9 
 
 
784 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  31.25 
 
 
688 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  31.98 
 
 
786 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.97 
 
 
825 aa  237  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  29.12 
 
 
778 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  29.12 
 
 
778 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  29.12 
 
 
778 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.72 
 
 
778 aa  233  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.72 
 
 
778 aa  233  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  28.72 
 
 
778 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  28.99 
 
 
778 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  26.17 
 
 
813 aa  231  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  28.95 
 
 
778 aa  231  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  28.72 
 
 
778 aa  231  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  28.72 
 
 
770 aa  230  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  32.5 
 
 
726 aa  230  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  29.33 
 
 
711 aa  229  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  27.99 
 
 
792 aa  229  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  28.02 
 
 
806 aa  228  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  28.82 
 
 
834 aa  226  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.89 
 
 
698 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  27.71 
 
 
698 aa  223  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30.16 
 
 
833 aa  220  8.999999999999998e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  25.89 
 
 
740 aa  219  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.99 
 
 
795 aa  216  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  27.59 
 
 
742 aa  212  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  27.2 
 
 
825 aa  207  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  27.2 
 
 
825 aa  207  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3804  ATPase  26.87 
 
 
686 aa  207  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  31.59 
 
 
659 aa  203  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  37 
 
 
772 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  27.18 
 
 
810 aa  202  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>