More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0455 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0455  RecD/TraA family helicase  100 
 
 		 731 aa  1445    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.232252  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl322  exodeoxyribonuclease V  40.24 
 
 		 743 aa  494  9.999999999999999e-139  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862926  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30.18 
 
 		 825 aa  254  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  31.19 
 
 		 792 aa  253  6e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  28.91 
 
 		 784 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  25.77 
 
 		 738 aa  241  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  26.56 
 
 		 728 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  29.77 
 
 		 710 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  28.16 
 
 		 772 aa  238  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.07 
 
 		 778 aa  236  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  28.07 
 
 		 778 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.94 
 
 		 778 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  28.07 
 
 		 778 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  27.94 
 
 		 778 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1106  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30.32 
 
 		 766 aa  235  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.710549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  27.03 
 
 		 731 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  27.8 
 
 		 778 aa  235  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  29.32 
 
 		 726 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  27.94 
 
 		 770 aa  235  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  26 
 
 		 740 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  27.94 
 
 		 778 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  27.8 
 
 		 778 aa  233  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.42 
 
 		 833 aa  231  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  26.97 
 
 		 719 aa  231  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  25.98 
 
 		 736 aa  230  8e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  26.12 
 
 		 728 aa  230  8e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  27.82 
 
 		 778 aa  229  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  26.13 
 
 		 768 aa  227  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  24.9 
 
 		 740 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  28.69 
 
 		 825 aa  225  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  28.69 
 
 		 825 aa  225  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  27.12 
 
 		 786 aa  223  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  26.79 
 
 		 724 aa  223  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  23.27 
 
 		 733 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  28.22 
 
 		 806 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  25.07 
 
 		 726 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  27.85 
 
 		 810 aa  221  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  25.38 
 
 		 731 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  23.14 
 
 		 733 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  23.9 
 
 		 688 aa  219  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  22.32 
 
 		 736 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  23.72 
 
 		 738 aa  217  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  26.26 
 
 		 738 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.03 
 
 		 795 aa  217  7e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  28.16 
 
 		 834 aa  217  7e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  24.32 
 
 		 742 aa  216  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  23.47 
 
 		 731 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  24.97 
 
 		 747 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  25.41 
 
 		 728 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  22.68 
 
 		 727 aa  214  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  25.23 
 
 		 737 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  25.07 
 
 		 732 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  25.78 
 
 		 722 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  22.15 
 
 		 762 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  23.55 
 
 		 736 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  24.69 
 
 		 727 aa  211  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  24.16 
 
 		 750 aa  210  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  25.14 
 
 		 728 aa  210  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  25.1 
 
 		 728 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  23.09 
 
 		 735 aa  209  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  24.2 
 
 		 724 aa  209  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  22.62 
 
 		 739 aa  209  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  26.87 
 
 		 732 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  21.68 
 
 		 750 aa  209  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  25.11 
 
 		 739 aa  208  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  24.1 
 
 		 749 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  26.02 
 
 		 719 aa  208  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  30.75 
 
 		 744 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  30.46 
 
 		 744 aa  207  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  24.43 
 
 		 744 aa  207  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  23.55 
 
 		 731 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  21.98 
 
 		 744 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  21.85 
 
 		 741 aa  205  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  32.92 
 
 		 744 aa  204  6e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  29.94 
 
 		 735 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  23.72 
 
 		 711 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  24.77 
 
 		 733 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  27.14 
 
 		 742 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  28.01 
 
 		 741 aa  197  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  24.62 
 
 		 749 aa  196  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf852  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.34 
 
 		 732 aa  195  3e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  30.19 
 
 		 719 aa  193  7e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  22.31 
 
 		 725 aa  193  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  27.85 
 
 		 659 aa  193  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  22.9 
 
 		 726 aa  190  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  23.36 
 
 		 731 aa  188  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.34 
 
 		 746 aa  187  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4627  RecD/TraA family helicase  30.61 
 
 		 871 aa  187  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0750551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  26.24 
 
 		 742 aa  185  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  26.44 
 
 		 746 aa  184  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  26.04 
 
 		 813 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  23.75 
 
 		 728 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  25.26 
 
 		 715 aa  182  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  22.87 
 
 		 742 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  26.8 
 
 		 772 aa  181  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  22.87 
 
 		 653 aa  181  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  24.83 
 
 		 776 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  24.68 
 
 		 740 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5408  helicase, RecD/TraA family  26.87 
 
 		 741 aa  178  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.68949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  24.17 
 
 		 698 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>