More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0593 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0587  AAA ATPase  100 
 
 		 717 aa  1491    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  100 
 
 		 717 aa  1491    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0593  AAA ATPase  100 
 
 		 717 aa  1491    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  75.83 
 
 		 721 aa  1132    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  40.98 
 
 		 710 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0188  putative helicase  36.07 
 
 		 788 aa  438  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  31.89 
 
 		 730 aa  312  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  28.73 
 
 		 637 aa  224  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  29.36 
 
 		 747 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.12 
 
 		 698 aa  190  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  28.68 
 
 		 698 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  26.81 
 
 		 762 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  27.43 
 
 		 725 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  26.89 
 
 		 750 aa  184  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  27.54 
 
 		 727 aa  181  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  27.76 
 
 		 736 aa  180  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  27.1 
 
 		 744 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  26.66 
 
 		 739 aa  177  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  26.45 
 
 		 740 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  27.34 
 
 		 728 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  26.51 
 
 		 731 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  26.28 
 
 		 728 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  28.72 
 
 		 728 aa  174  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  27.09 
 
 		 738 aa  174  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  26.37 
 
 		 741 aa  173  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  26.75 
 
 		 738 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  27.35 
 
 		 731 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  26.55 
 
 		 731 aa  171  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  29.15 
 
 		 732 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  26.46 
 
 		 735 aa  171  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  26.48 
 
 		 731 aa  171  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  27.41 
 
 		 740 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  25.45 
 
 		 744 aa  170  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  26.37 
 
 		 742 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  26.75 
 
 		 726 aa  169  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  27.01 
 
 		 724 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  26.47 
 
 		 711 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  25.97 
 
 		 728 aa  167  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  27.84 
 
 		 749 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  27.53 
 
 		 719 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  26.12 
 
 		 736 aa  165  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  27.77 
 
 		 722 aa  165  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  26.15 
 
 		 749 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  27.27 
 
 		 724 aa  164  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  26.49 
 
 		 742 aa  164  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  25.33 
 
 		 733 aa  163  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  28.36 
 
 		 719 aa  162  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  31.37 
 
 		 720 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  25.14 
 
 		 733 aa  161  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.15 
 
 		 825 aa  161  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  24.52 
 
 		 727 aa  161  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  23.72 
 
 		 747 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  26.02 
 
 		 754 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  29.03 
 
 		 688 aa  160  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  26.15 
 
 		 742 aa  160  9e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  26.33 
 
 		 746 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  25.88 
 
 		 746 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  25.11 
 
 		 768 aa  158  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  25.46 
 
 		 744 aa  158  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  25.46 
 
 		 744 aa  158  4e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  27.71 
 
 		 742 aa  156  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  25.44 
 
 		 750 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  26.09 
 
 		 740 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  26.23 
 
 		 813 aa  156  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  26.72 
 
 		 735 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  26.6 
 
 		 834 aa  156  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  26.52 
 
 		 728 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  26.57 
 
 		 737 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.26 
 
 		 795 aa  155  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  26.73 
 
 		 719 aa  153  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  25.08 
 
 		 659 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  24.93 
 
 		 739 aa  153  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  25.11 
 
 		 710 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  26.57 
 
 		 732 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  25.44 
 
 		 741 aa  151  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  26.67 
 
 		 738 aa  151  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  27.1 
 
 		 733 aa  150  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  25.54 
 
 		 786 aa  150  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.98 
 
 		 744 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  25.48 
 
 		 740 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  24.67 
 
 		 784 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  25.24 
 
 		 728 aa  147  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  25.15 
 
 		 778 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  25.3 
 
 		 778 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  25.45 
 
 		 778 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  26.19 
 
 		 792 aa  145  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  25 
 
 		 778 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25 
 
 		 778 aa  145  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25 
 
 		 778 aa  144  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  25 
 
 		 778 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  25.15 
 
 		 778 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  25.08 
 
 		 742 aa  144  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  25.96 
 
 		 806 aa  142  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  25 
 
 		 778 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  25 
 
 		 770 aa  142  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  26.09 
 
 		 728 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  25.97 
 
 		 728 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  23.56 
 
 		 772 aa  137  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  24.52 
 
 		 825 aa  137  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  24.52 
 
 		 825 aa  137  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>