More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0183 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0183  hypothetical protein  100 
 
 		 879 aa  1816    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0169  hypothetical protein  92.04 
 
 		 881 aa  1671    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  33.74 
 
 		 952 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  33.47 
 
 		 952 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2653  conjugal transfer relaxase TraA  33.29 
 
 		 976 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0272  conjugal transfer relaxase TraA  33.29 
 
 		 976 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.618636  normal  0.122916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  32.93 
 
 		 968 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  32.25 
 
 		 1039 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3191  conjugal transfer relaxase TraA  32.65 
 
 		 974 aa  382  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  31.89 
 
 		 998 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  33.33 
 
 		 1107 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6372  conjugal transfer relaxase TraA  32.57 
 
 		 982 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  32.78 
 
 		 1102 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  32.52 
 
 		 1102 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  31.96 
 
 		 998 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  31.81 
 
 		 1034 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  33.01 
 
 		 985 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  31.94 
 
 		 1034 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3571  conjugal transfer relaxase TraA  32.44 
 
 		 1025 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.64 
 
 		 1095 aa  357  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4226  conjugal transfer relaxase TraA  31.96 
 
 		 1000 aa  357  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0036143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1543  conjugal transfer relaxase TraA  31.96 
 
 		 1000 aa  357  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.41653  normal  0.458262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.71 
 
 		 1105 aa  353  5.9999999999999994e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  33.06 
 
 		 1356 aa  350  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  31.46 
 
 		 1006 aa  350  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  32.08 
 
 		 1100 aa  350  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0178  conjugal transfer relaxase TraA  31.64 
 
 		 814 aa  349  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.36 
 
 		 1098 aa  348  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.31 
 
 		 1098 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.04 
 
 		 1102 aa  340  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  30.58 
 
 		 1557 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  31.15 
 
 		 1100 aa  333  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  30.93 
 
 		 1107 aa  333  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4244  MobA/MobL protein  29.83 
 
 		 1168 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.944992  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  30.89 
 
 		 1123 aa  327  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.53 
 
 		 1536 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5575  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  31.41 
 
 		 1245 aa  312  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.241587 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5003  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  29.83 
 
 		 1538 aa  300  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0650  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  30.82 
 
 		 1534 aa  291  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  32.36 
 
 		 907 aa  241  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  31.95 
 
 		 1093 aa  191  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  26.27 
 
 		 918 aa  156  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3228  MobA/MobL protein  29.08 
 
 		 447 aa  146  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  44.87 
 
 		 361 aa  135  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5620  MobA/MobL protein  39.78 
 
 		 726 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  39.57 
 
 		 498 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5602  hypothetical protein  37.24 
 
 		 730 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  25 
 
 		 981 aa  128  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  33.03 
 
 		 544 aa  126  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  42.14 
 
 		 719 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3227  conjugal transfer protein traA  32.44 
 
 		 267 aa  125  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  27.91 
 
 		 710 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5348  mobilization protein  37.31 
 
 		 407 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1747  MobA/MobL protein  35.05 
 
 		 465 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D28  hypothetical protein  44.22 
 
 		 673 aa  114  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00718795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.37 
 
 		 721 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4932  TrwC relaxase  27.27 
 
 		 2090 aa  113  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00370  conjugative relaxase domain protein, TrwC/TraI family  29.21 
 
 		 1174 aa  109  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06440  TrwC relaxase  28.5 
 
 		 1184 aa  107  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  27.05 
 
 		 637 aa  106  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2074  MobA/MobL family  33.7 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.103874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  33.7 
 
 		 506 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  27.56 
 
 		 1175 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2792  exonuclease V subunit alpha  26.32 
 
 		 1955 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.282782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  26.25 
 
 		 1797 aa  103  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  37.85 
 
 		 498 aa  101  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1430  exonuclease V subunit alpha  25.71 
 
 		 1523 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1448  exonuclease V subunit alpha  25.71 
 
 		 1523 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.999122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  24.6 
 
 		 1836 aa  100  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  23.94 
 
 		 1623 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4800  DNA primase catalytic core  26.8 
 
 		 1967 aa  99.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1102  exonuclease V subunit alpha  26.56 
 
 		 872 aa  99  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3734  exonuclease V subunit alpha  26.84 
 
 		 1952 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3615  TrwC relaxase  25.58 
 
 		 1481 aa  97.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  25.81 
 
 		 1976 aa  96.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004252  pDOJH10L_p07  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  95.1  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  27.03 
 
 		 659 aa  95.1  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1721  exonuclease V subunit alpha  25.13 
 
 		 866 aa  95.1  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  27.89 
 
 		 747 aa  95.1  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  26.68 
 
 		 736 aa  94.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4936  DNA primase catalytic core  25.71 
 
 		 1980 aa  94.4  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471032  normal  0.076973 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0593  AAA ATPase  28.53 
 
 		 717 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  28.53 
 
 		 717 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2336  TrwC relaxase  26.37 
 
 		 1176 aa  93.6  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0587  AAA ATPase  28.53 
 
 		 717 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  26.19 
 
 		 742 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  25.12 
 
 		 1665 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4895  exodeoxyribonuclease V  27.51 
 
 		 776 aa  91.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382382  normal  0.0563011 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  25.66 
 
 		 741 aa  91.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  27.71 
 
 		 1231 aa  91.3  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4998  MobA/MobL protein  36.78 
 
 		 766 aa  90.1  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1852  ATPase  26.26 
 
 		 745 aa  88.2  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  27.3 
 
 		 720 aa  87.8  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3656  AAA ATPase  27.35 
 
 		 641 aa  87.4  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  25.94 
 
 		 742 aa  87.4  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  23.97 
 
 		 746 aa  87.4  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  26.37 
 
 		 735 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3254  exonuclease V subunit alpha  24.5 
 
 		 1529 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  24.76 
 
 		 736 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.59 
 
 		 833 aa  83.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>