More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2919 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0562  AAA ATPase  75.83 
 
 		 717 aa  1131    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0587  AAA ATPase  75.83 
 
 		 717 aa  1131    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2919  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  100 
 
 		 721 aa  1508    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0593  AAA ATPase  75.83 
 
 		 717 aa  1131    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0306  AAA ATPase  40.42 
 
 		 710 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.933314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0188  putative helicase  35.16 
 
 		 788 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1706  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V), alpha subunit  30.19 
 
 		 730 aa  290  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3229  Exodeoxyribonuclease V  29.48 
 
 		 637 aa  236  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.115754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2305  AAA ATPase  26.07 
 
 		 747 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.476827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  29.2 
 
 		 732 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  28.05 
 
 		 736 aa  196  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  26.9 
 
 		 728 aa  194  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  27.92 
 
 		 727 aa  190  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  26.75 
 
 		 750 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  26.69 
 
 		 724 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  26.66 
 
 		 728 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  26.62 
 
 		 762 aa  183  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  27.72 
 
 		 735 aa  183  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  26.52 
 
 		 738 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  26.23 
 
 		 744 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  26.34 
 
 		 736 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  28.46 
 
 		 728 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  26.5 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  26.15 
 
 		 746 aa  179  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  26.84 
 
 		 725 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  27.67 
 
 		 749 aa  178  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  26.55 
 
 		 738 aa  177  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  27.13 
 
 		 731 aa  177  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  26.77 
 
 		 741 aa  177  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  27.81 
 
 		 724 aa  177  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  28.22 
 
 		 742 aa  177  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  25.49 
 
 		 744 aa  177  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  28.08 
 
 		 722 aa  177  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  27.83 
 
 		 742 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  26.31 
 
 		 731 aa  174  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  27 
 
 		 719 aa  174  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  24.86 
 
 		 739 aa  173  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.52 
 
 		 698 aa  173  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  26.84 
 
 		 733 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  26.54 
 
 		 731 aa  171  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  26.68 
 
 		 742 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.05 
 
 		 795 aa  171  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  25.34 
 
 		 710 aa  170  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  26.96 
 
 		 719 aa  170  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  24.6 
 
 		 768 aa  170  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  25.99 
 
 		 739 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  28.55 
 
 		 711 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  26.67 
 
 		 698 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  27.38 
 
 		 731 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  25.74 
 
 		 738 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  25 
 
 		 754 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  26.15 
 
 		 733 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  26.27 
 
 		 746 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  24.84 
 
 		 747 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  27.01 
 
 		 719 aa  168  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  25.14 
 
 		 720 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  27.99 
 
 		 688 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  25.45 
 
 		 728 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  25.64 
 
 		 728 aa  164  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  26.03 
 
 		 749 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  25.17 
 
 		 750 aa  162  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  25.15 
 
 		 727 aa  162  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  25.9 
 
 		 740 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  26.56 
 
 		 740 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  26.87 
 
 		 732 aa  158  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  26.12 
 
 		 735 aa  157  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  26.56 
 
 		 740 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.58 
 
 		 825 aa  157  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  25.84 
 
 		 728 aa  156  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  28.06 
 
 		 726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  27.23 
 
 		 736 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  25.71 
 
 		 741 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  25.43 
 
 		 744 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  25.53 
 
 		 744 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  25.74 
 
 		 740 aa  153  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  26.65 
 
 		 742 aa  153  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  24.96 
 
 		 786 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  26.17 
 
 		 737 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  25.62 
 
 		 792 aa  151  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  26.05 
 
 		 733 aa  151  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  26.19 
 
 		 806 aa  150  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  25.43 
 
 		 834 aa  147  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  25.11 
 
 		 659 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  26.85 
 
 		 653 aa  146  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  24.1 
 
 		 784 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  26.38 
 
 		 728 aa  144  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  24.15 
 
 		 813 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  24.57 
 
 		 772 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  24.53 
 
 		 742 aa  141  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  25.38 
 
 		 778 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  25.3 
 
 		 778 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.28 
 
 		 744 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  25.08 
 
 		 778 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  25.38 
 
 		 778 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1106  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  24.73 
 
 		 766 aa  138  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.710549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  25.08 
 
 		 778 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  24.92 
 
 		 778 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  24.92 
 
 		 778 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  24.81 
 
 		 778 aa  137  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  24.09 
 
 		 772 aa  137  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>