35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2179 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2179  hypothetical protein  100 
 
 
1010 aa  2089    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2115  hypothetical protein  66.5 
 
 
1009 aa  1410    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5420  hypothetical protein  38.26 
 
 
1170 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0281  hypothetical protein  43.6 
 
 
1065 aa  798    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2159  hypothetical protein  66.3 
 
 
1009 aa  1406    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135027  normal  0.649366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1066  hypothetical protein  61.95 
 
 
1015 aa  1305    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619549  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5286  hypothetical protein  38.8 
 
 
971 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.55512  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0044  hypothetical protein  37.6 
 
 
967 aa  621  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0078  hypothetical protein  38.05 
 
 
962 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.253673 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5619  hypothetical protein  34.13 
 
 
1003 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1772  hypothetical protein  34.69 
 
 
1039 aa  546  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4775  hypothetical protein  36.66 
 
 
1034 aa  547  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.527155  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5473  hypothetical protein  30.37 
 
 
1114 aa  337  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.467574 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5632  hypothetical protein  34.5 
 
 
1138 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000206849 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2633  hypothetical protein  27.49 
 
 
999 aa  226  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.753628  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4602  hypothetical protein  25.49 
 
 
1160 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0025  hypothetical protein  38.62 
 
 
1194 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  37.85 
 
 
812 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4558  hypothetical protein  25.5 
 
 
1173 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3915  hypothetical protein  26.24 
 
 
1283 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0011  hypothetical protein  36.13 
 
 
1227 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2433  hypothetical protein  25.08 
 
 
1387 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  36.67 
 
 
1665 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4533  hypothetical protein  28.91 
 
 
1403 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0371536  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4290  hypothetical protein  30.32 
 
 
669 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3046  hypothetical protein  24.64 
 
 
504 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.117298  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4577  hypothetical protein  23.87 
 
 
919 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3045  Signal recognition particle GTPase  30.06 
 
 
514 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.698368  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0212  hypothetical protein  25.74 
 
 
731 aa  58.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_220  hypothetical protein  25.74 
 
 
727 aa  56.2  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0099  hypothetical protein  27.38 
 
 
437 aa  52.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0156  hypothetical protein  26.63 
 
 
437 aa  52  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000439773 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0125  hypothetical protein  25.7 
 
 
438 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000340794 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0033  hypothetical protein  26.32 
 
 
307 aa  47  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2574  hypothetical protein  26.88 
 
 
426 aa  45.8  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.416685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>