295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2376 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 797 aa  1622    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  42.55 
 
 		 771 aa  635  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  40.7 
 
 		 779 aa  577  1.0000000000000001e-163  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  40.72 
 
 		 800 aa  552  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  39.83 
 
 		 791 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  37.96 
 
 		 777 aa  513  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  37.49 
 
 		 822 aa  512  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  36.92 
 
 		 767 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  28.98 
 
 		 800 aa  108  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 753 aa  106  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  24.13 
 
 		 772 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 		 875 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 792 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  23.62 
 
 		 859 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  22.24 
 
 		 874 aa  98.2  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 804 aa  97.4  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  22.59 
 
 		 789 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  23.23 
 
 		 897 aa  94  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 814 aa  91.3  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 935 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  21.61 
 
 		 923 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 806 aa  84.3  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 775 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 790 aa  82.4  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 787 aa  81.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  22.99 
 
 		 814 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 966 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 1089 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 793 aa  75.1  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 772 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  24.16 
 
 		 872 aa  75.1  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  22.71 
 
 		 881 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  24.35 
 
 		 780 aa  74.3  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 852 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 775 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 800 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1109 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  22.22 
 
 		 917 aa  70.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 831 aa  70.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1147 aa  70.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1126 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1075 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 923 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 791 aa  67.8  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 998 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 888 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1120 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1122 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1008 aa  66.6  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 927 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  23.06 
 
 		 866 aa  65.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  24.57 
 
 		 821 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 1001 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  23.39 
 
 		 928 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 931 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  26.94 
 
 		 888 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4145  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 865 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0626141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 798 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 781 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 991 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 1087 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 993 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1036 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  37.89 
 
 		 973 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  25.51 
 
 		 827 aa  62  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1003 aa  62  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1234  TonB-dependent receptor plug  22.69 
 
 		 716 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 952 aa  61.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1059 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 828 aa  60.8  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  41.05 
 
 		 869 aa  61.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1100 aa  61.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  20.42 
 
 		 803 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 735 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 962 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  25.54 
 
 		 781 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 989 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 813 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1059 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 813 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 897 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 730 aa  59.3  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1014 aa  59.3  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 933 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1036 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1047 aa  58.5  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 962 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1040 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 957 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 757 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 836 aa  57.8  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 988 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 979 aa  57.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  38.95 
 
 		 793 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  29.17 
 
 		 829 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 1008 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  24.24 
 
 		 906 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04680  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 757 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.868178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  36.73 
 
 		 934 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>