More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2101 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1038 aa  2123    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1094 aa  463  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1109 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1006 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1027 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 1036 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1123 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1130 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 1018 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1145 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1056 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 1061 aa  366  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 1144 aa  361  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 1033 aa  360  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 1045 aa  349  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1062 aa  348  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1029 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 1081 aa  343  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 1056 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1086 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1148 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1033 aa  334  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1176 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1127 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1043 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1068 aa  320  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 937 aa  320  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 1086 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1047 aa  314  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1060 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 1130 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 953 aa  311  5e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1142 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1056 aa  307  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1020 aa  305  4.0000000000000003e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1139 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1188 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1036 aa  300  9e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1026 aa  297  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 1026 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1012 aa  295  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1031 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1155 aa  291  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1095 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 1020 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 1025 aa  287  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1013 aa  287  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1146 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1036 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1168 aa  285  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1034 aa  285  4.0000000000000003e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1077 aa  282  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1181 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1217 aa  280  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 1164 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1131 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1148 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1079 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1128 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1037 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1028 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1161 aa  275  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 1075 aa  271  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1096 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1128 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1147 aa  269  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  27.56 
 
 		 1013 aa  268  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 1138 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1129 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 1065 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1051 aa  265  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1079 aa  264  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1066 aa  262  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1029 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1190 aa  261  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1102 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1164 aa  261  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  28.17 
 
 		 1002 aa  260  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 913 aa  260  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 1132 aa  257  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1008 aa  257  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1038 aa  257  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1051 aa  255  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1008 aa  254  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1053 aa  253  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1150 aa  251  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 994 aa  250  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 929 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 1093 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1192 aa  247  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 1074 aa  247  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1023 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1036 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1114 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 1189 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1152 aa  241  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 1033 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1053 aa  240  9e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 1147 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1155 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>