More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0007 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  100 
 
 
641 aa  1300  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 
666 aa  189  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 
695 aa  186  8e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  8.98905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
712 aa  180  6e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  2.26653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
687 aa  180  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 
728 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
853 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 
720 aa  166  1e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 
736 aa  166  1e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 
851 aa  164  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
743 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  25.16 
 
 
673 aa  151  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
743 aa  150  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 
732 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 
744 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.23864e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 
729 aa  150  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 
744 aa  150  1e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  5.83553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 
741 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.4 
 
 
715 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 
757 aa  147  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 
690 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 
710 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
729 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  7.50921e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
713 aa  145  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 
733 aa  144  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
748 aa  144  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 
700 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 
695 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 
670 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 
737 aa  141  4e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 
733 aa  141  5e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 
732 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
694 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.78 
 
 
685 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 
690 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
744 aa  139  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 
718 aa  138  3e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 
713 aa  135  2e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 
733 aa  135  2e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
711 aa  135  2e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  9.46048e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 
750 aa  135  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
722 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 
758 aa  134  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 
794 aa  134  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 
790 aa  133  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 
775 aa  132  1e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 
729 aa  133  1e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  22.71 
 
 
691 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  22.98 
 
 
759 aa  131  4e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 
730 aa  131  5e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 
764 aa  131  5e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
774 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  23.66 
 
 
669 aa  129  1e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 
758 aa  130  1e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
719 aa  129  2e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 
725 aa  129  2e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
702 aa  129  2e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  5.40128e-05  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 
749 aa  129  2e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  3.58025e-10  decreased coverage  1.02915e-05 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 
704 aa  127  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 
761 aa  127  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.09 
 
 
755 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 
697 aa  126  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  23.9 
 
 
771 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 
726 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
761 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 
758 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
730 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
711 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 
787 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 
692 aa  124  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 
794 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  9.82846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 
758 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1400  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 
678 aa  123  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 
759 aa  123  1e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 
753 aa  123  1e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  24.19 
 
 
694 aa  122  2e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 
720 aa  122  2e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 
736 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
803 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 
741 aa  122  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 
747 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 
783 aa  120  8e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 
771 aa  120  1e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 
726 aa  120  1e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  22.08 
 
 
785 aa  119  2e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  21.86 
 
 
748 aa  119  2e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  9.1536e-08  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 
694 aa  118  4e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 
734 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 
680 aa  117  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 
753 aa  117  7e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25 
 
 
732 aa  117  8e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 
780 aa  116  1e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 
686 aa  116  1e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 
758 aa  115  2e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
758 aa  115  2e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 
769 aa  114  4e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 
712 aa  114  4e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  21.79 
 
 
761 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 
776 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 
713 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>