162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2661 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  100 
 
 		 792 aa  1620    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  38.6 
 
 		 799 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  33.93 
 
 		 822 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  33.2 
 
 		 794 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  32.16 
 
 		 636 aa  240  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  29.94 
 
 		 637 aa  174  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  35.57 
 
 		 751 aa  164  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  24.71 
 
 		 735 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  28.41 
 
 		 627 aa  132  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.65 
 
 		 1162 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  35.71 
 
 		 1371 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  33.85 
 
 		 1657 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  34.87 
 
 		 1389 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  27.54 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  35.06 
 
 		 2772 aa  99.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  25.21 
 
 		 561 aa  97.8  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1064 aa  97.4  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  23.84 
 
 		 886 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  27.49 
 
 		 2807 aa  96.3  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  27.78 
 
 		 2454 aa  95.5  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.95 
 
 		 1606 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  27.49 
 
 		 2367 aa  94.4  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  27.78 
 
 		 2421 aa  94.4  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  27.49 
 
 		 2411 aa  94.4  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1059 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  32.54 
 
 		 3227 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1313 aa  90.5  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  23.98 
 
 		 1620 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  25.81 
 
 		 615 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1245 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.15 
 
 		 1288 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  23.99 
 
 		 1602 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  30.85 
 
 		 2064 aa  85.5  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  23.67 
 
 		 1222 aa  84.7  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  25.21 
 
 		 890 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  26.91 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  33.54 
 
 		 1526 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  25.32 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  23.91 
 
 		 541 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  36.52 
 
 		 750 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  24.1 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  33.55 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1287 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  30.05 
 
 		 938 aa  77.4  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.32 
 
 		 2296 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1259 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1193 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  29.27 
 
 		 991 aa  75.5  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  28.23 
 
 		 726 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  28.83 
 
 		 2927 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  24.6 
 
 		 1097 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  27.59 
 
 		 885 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  30.42 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1139 aa  74.3  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.82 
 
 		 1266 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  32.48 
 
 		 2713 aa  72.8  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  32.3 
 
 		 775 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  23.43 
 
 		 2980 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.48 
 
 		 1466 aa  71.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  24.25 
 
 		 2270 aa  71.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1329 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  22.29 
 
 		 3542 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  23.67 
 
 		 2972 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1228 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  21.87 
 
 		 1140 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  27.94 
 
 		 1750 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1488 aa  68.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  25.13 
 
 		 3793 aa  68.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  22.06 
 
 		 532 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  22.63 
 
 		 540 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  40.18 
 
 		 963 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1066 aa  65.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  25.19 
 
 		 808 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1547 aa  64.3  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  37.18 
 
 		 711 aa  64.3  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  23.65 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  43.48 
 
 		 3602 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  40.79 
 
 		 652 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1980 aa  62.4  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  34.62 
 
 		 6497 aa  61.6  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  35.48 
 
 		 2005 aa  61.6  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  27.4 
 
 		 2377 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  40 
 
 		 658 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  25.54 
 
 		 1108 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  24.21 
 
 		 1152 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  35.62 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  23.47 
 
 		 797 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  44.26 
 
 		 4896 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  22.19 
 
 		 1247 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  36.84 
 
 		 969 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  22.63 
 
 		 1474 aa  58.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  32.14 
 
 		 694 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  23.23 
 
 		 1295 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  22.83 
 
 		 3851 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  24.07 
 
 		 3682 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  32.56 
 
 		 1230 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  32.61 
 
 		 950 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  29.8 
 
 		 815 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  22.75 
 
 		 1002 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  38.03 
 
 		 490 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>