More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2103 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2103  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 966 aa  1981    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.994808  normal  0.204772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 937 aa  272  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 913 aa  244  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 1018 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 953 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1123 aa  222  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  25.79 
 
 		 1109 aa  218  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1006 aa  218  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1027 aa  217  9e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 1025 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1043 aa  206  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1029 aa  204  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 1144 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 929 aa  199  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 1061 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1033 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 1086 aa  196  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 1045 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 1047 aa  191  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1130 aa  191  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 1026 aa  191  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1036 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1128 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1094 aa  189  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 1019 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 1145 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 1164 aa  180  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 986 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  23.81 
 
 		 1056 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 917 aa  178  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1013 aa  177  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  24.35 
 
 		 1036 aa  177  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1168 aa  177  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1056 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 1020 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1034 aa  176  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 1081 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 1095 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 1033 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  24.12 
 
 		 1068 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 		 1038 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 1020 aa  166  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 1176 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 1095 aa  166  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 1055 aa  164  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 1065 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 1056 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 1031 aa  163  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 1116 aa  162  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 1062 aa  161  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 1093 aa  161  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 1046 aa  160  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 1161 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 1130 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 		 1177 aa  158  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 1049 aa  158  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  23.47 
 
 		 1146 aa  157  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  25.22 
 
 		 1005 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 1086 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  22.8 
 
 		 989 aa  155  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  23.52 
 
 		 1128 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3390  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1150 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.532087  normal  0.341167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 1084 aa  148  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1131 aa  147  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 1128 aa  145  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  22.53 
 
 		 1102 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 1004 aa  143  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1127 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  23.33 
 
 		 1043 aa  140  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  23.36 
 
 		 1038 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 1011 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  22.99 
 
 		 1129 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  22.94 
 
 		 1036 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 1038 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 		 1052 aa  131  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  22.23 
 
 		 1060 aa  131  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 1189 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  23.07 
 
 		 1188 aa  128  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  22.56 
 
 		 979 aa  127  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1139 aa  127  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  22.86 
 
 		 1006 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 1033 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  22.82 
 
 		 1064 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  21.7 
 
 		 1096 aa  124  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 986 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  22.32 
 
 		 1119 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  22.77 
 
 		 1147 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  22.84 
 
 		 1085 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  21.42 
 
 		 1025 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 1066 aa  121  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  22.79 
 
 		 1048 aa  120  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 1039 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 1075 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  22.86 
 
 		 1130 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 1144 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  23.25 
 
 		 1071 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1164 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  23.38 
 
 		 1062 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 		 1122 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 1037 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>