95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1449 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 799 aa  1679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  34.66 
 
 		 743 aa  468  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  32.25 
 
 		 784 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 781 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  36.39 
 
 		 729 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  34.45 
 
 		 778 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  32.51 
 
 		 742 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 828 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  30.92 
 
 		 773 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  33.04 
 
 		 708 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 764 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  30.17 
 
 		 817 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 771 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  30.78 
 
 		 755 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 802 aa  328  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  29.13 
 
 		 758 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 764 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  29.44 
 
 		 651 aa  296  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  31.02 
 
 		 649 aa  293  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 687 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  25.82 
 
 		 767 aa  201  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  23.42 
 
 		 640 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  25.45 
 
 		 394 aa  87.8  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  22.83 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  24.88 
 
 		 403 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 351 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  24.56 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2654  hypothetical protein  27.14 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3428  TPR domain-containing protein  27.37 
 
 		 399 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  22.67 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  21.83 
 
 		 556 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  22.2 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  20.73 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 2240 aa  59.7  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6276  hypothetical protein  20.68 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2970  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47174  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  24.37 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3102  TPR domain protein  26.87 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0131637  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20.43 
 
 		 725 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  24.14 
 
 		 595 aa  54.7  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  24.46 
 
 		 676 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 744 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 313 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 3145 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003597  FOG: TPR repeat protein  24.41 
 
 		 345 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  24.63 
 
 		 676 aa  50.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  22.28 
 
 		 697 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  22.78 
 
 		 678 aa  50.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 935 aa  50.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  36.59 
 
 		 564 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 637 aa  49.3  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  23.42 
 
 		 676 aa  48.5  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 878 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  25.89 
 
 		 333 aa  48.5  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  20.78 
 
 		 516 aa  47.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  23.4 
 
 		 678 aa  47.8  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 		 364 aa  47.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.47 
 
 		 661 aa  47.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  23.76 
 
 		 678 aa  47.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 441 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.92 
 
 		 810 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  20.57 
 
 		 687 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 203 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 566 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 441 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.02 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  24.2 
 
 		 442 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 564 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 184 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 645 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  30.3 
 
 		 816 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  26.26 
 
 		 1077 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  18.02 
 
 		 632 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.35 
 
 		 577 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  27.35 
 
 		 577 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 290 aa  45.8  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  22.92 
 
 		 1252 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 612 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.92 
 
 		 1252 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 1085 aa  45.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 269 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  21.77 
 
 		 519 aa  45.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  21.82 
 
 		 679 aa  44.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  24.11 
 
 		 329 aa  44.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 		 737 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 968 aa  44.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  21.6 
 
 		 622 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 754 aa  44.3  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 468 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.02 
 
 		 1022 aa  44.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  24.28 
 
 		 469 aa  44.3  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 681 aa  44.3  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 402 aa  44.3  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>