More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1694 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  453  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  44.13 
 
 		 243 aa  201  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  33.85 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 193 aa  98.2  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 202 aa  94.7  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  24.73 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  26.52 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  36.07 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 260 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.1 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  53.19 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  27.35 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1439  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.187037  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 497 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 770 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.45 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1703  TetR family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.45 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.45 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 291 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>