102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3115 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 509 aa  1040    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  46.09 
 
 		 530 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  41.2 
 
 		 492 aa  370  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  38.76 
 
 		 489 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  36.03 
 
 		 518 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  34.88 
 
 		 524 aa  258  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  33.27 
 
 		 543 aa  253  7e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  28.48 
 
 		 559 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  29.8 
 
 		 537 aa  183  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  31.41 
 
 		 542 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  29.16 
 
 		 548 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  34.8 
 
 		 479 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  30.58 
 
 		 448 aa  147  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 491 aa  146  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  26.48 
 
 		 649 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  28.91 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  29.53 
 
 		 455 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  31.58 
 
 		 447 aa  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 		 475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  28.05 
 
 		 443 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  26.19 
 
 		 444 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  28.97 
 
 		 544 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  25.97 
 
 		 470 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  29.05 
 
 		 454 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  29.2 
 
 		 454 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  23.54 
 
 		 541 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  28.62 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  28.57 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  29.52 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  27.81 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  29.21 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  32.34 
 
 		 528 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  27.53 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  27.4 
 
 		 727 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  26.49 
 
 		 551 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  27.32 
 
 		 554 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 		 442 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 		 560 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  27.99 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  27.52 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  23.5 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  26.32 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  26.27 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  27.18 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  24.75 
 
 		 865 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  23.59 
 
 		 518 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  31.27 
 
 		 521 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  30.57 
 
 		 246 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  29.25 
 
 		 509 aa  94.4  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  26.29 
 
 		 390 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  27.23 
 
 		 271 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  25.48 
 
 		 508 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  27.78 
 
 		 604 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  28.52 
 
 		 605 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  25.17 
 
 		 602 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 606 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  25 
 
 		 451 aa  87.4  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  25.39 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  23.18 
 
 		 702 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  25.35 
 
 		 402 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  35.38 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  36.15 
 
 		 659 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  34.31 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  27.03 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  21.14 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  28.24 
 
 		 671 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  23.56 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  25.33 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  22.14 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  22.14 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  24.67 
 
 		 669 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  24.01 
 
 		 532 aa  57  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3587  hypothetical protein  23.15 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3660  hypothetical protein  23.15 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.805828  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0681  hypothetical protein  25.91 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  23.31 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3592  hypothetical protein  23.4 
 
 		 528 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237633  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  25.77 
 
 		 680 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3310  hypothetical protein  23.34 
 
 		 518 aa  54.7  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 665 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  25 
 
 		 513 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  42.47 
 
 		 983 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 		 665 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  20.76 
 
 		 664 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  28.57 
 
 		 544 aa  50.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  22.12 
 
 		 488 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1711  endopygalactorunase-like protein  24.74 
 
 		 620 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  35.21 
 
 		 547 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  24.79 
 
 		 931 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0172  coagulation factor 5/8 type domain protein  25 
 
 		 685 aa  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.238557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  42.86 
 
 		 582 aa  47.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2173  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.01 
 
 		 726 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207249  decreased coverage  0.0000037438 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  41.54 
 
 		 544 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>