More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2153 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  35.84 
 
 		 1058 aa  652    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1042 aa  2128    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  34.01 
 
 		 1123 aa  559  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  32.4 
 
 		 1048 aa  524  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 1033 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 1056 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1047 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 1086 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1095 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1095 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1079 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1060 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 1144 aa  360  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1155 aa  351  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  29.72 
 
 		 1027 aa  350  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1023 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1109 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1006 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 1130 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1046 aa  340  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1010 aa  340  8e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1148 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1177 aa  337  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 1050 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 1065 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1024 aa  334  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1031 aa  334  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1128 aa  333  8e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1094 aa  333  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 1045 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1127 aa  332  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1064 aa  330  6e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 1026 aa  330  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1128 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1142 aa  324  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1019 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1013 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1138 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1082 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 1023 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 1148 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1124 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1039 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1181 aa  317  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 996 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1161 aa  317  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1164 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1128 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1051 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 1036 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 1049 aa  313  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1026 aa  313  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1020 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1028 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1188 aa  312  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 		 1096 aa  310  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1006 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 994 aa  310  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1036 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1077 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1050 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1192 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 989 aa  308  4.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1087 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1029 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1017 aa  307  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1008 aa  305  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1168 aa  305  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 1037 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1058 aa  304  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1034 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1168 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 996 aa  301  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 1061 aa  301  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1042 aa  301  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1122 aa  300  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 1029 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1066 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1217 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 1031 aa  298  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 1011 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1114 aa  295  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1131 aa  295  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1074 aa  295  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 986 aa  294  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1062 aa  294  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 1071 aa  293  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1038 aa  292  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1008 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1041 aa  292  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1034 aa  292  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1036 aa  292  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1066 aa  290  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1036 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1010 aa  289  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1079 aa  288  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 1000 aa  287  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1202 aa  287  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1161 aa  287  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1004 aa  286  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>