153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3536 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 726 aa  1486    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  49.61 
 
 		 884 aa  496  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  47.25 
 
 		 465 aa  208  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  41.7 
 
 		 536 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  42.13 
 
 		 541 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  38.16 
 
 		 957 aa  151  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  38.28 
 
 		 389 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  54.1 
 
 		 673 aa  144  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  50 
 
 		 610 aa  135  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  37.85 
 
 		 1132 aa  130  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  47.93 
 
 		 1167 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  45.57 
 
 		 383 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  45.99 
 
 		 705 aa  123  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  49.23 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  52.25 
 
 		 461 aa  114  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  43.29 
 
 		 639 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  36.22 
 
 		 1391 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  50 
 
 		 613 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  54.65 
 
 		 450 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  44.52 
 
 		 569 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  28.66 
 
 		 615 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4739  hypothetical protein  28.9 
 
 		 791 aa  104  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  37.93 
 
 		 869 aa  104  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.83 
 
 		 933 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  60 
 
 		 692 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  41.98 
 
 		 982 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  43.06 
 
 		 503 aa  99.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  44.8 
 
 		 918 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  40.52 
 
 		 863 aa  94.4  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  51.65 
 
 		 1187 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  40 
 
 		 877 aa  93.2  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  43.52 
 
 		 823 aa  92  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.01 
 
 		 531 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  39.17 
 
 		 853 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  41.28 
 
 		 819 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42.2 
 
 		 802 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.67 
 
 		 870 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  40.74 
 
 		 845 aa  87.8  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  46.15 
 
 		 1141 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.59 
 
 		 840 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  40.74 
 
 		 1356 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.13 
 
 		 1321 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26040  hypothetical protein  26.75 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  36.55 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  38.89 
 
 		 1380 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  40.83 
 
 		 1091 aa  85.1  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  41.82 
 
 		 1024 aa  84.3  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 1338 aa  83.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  42.98 
 
 		 1295 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4760  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.24 
 
 		 393 aa  83.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.68587  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.57 
 
 		 580 aa  84  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  43.75 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 719 aa  82.4  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  28.31 
 
 		 566 aa  80.9  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  38.6 
 
 		 948 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6989  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.84 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  35.96 
 
 		 630 aa  77  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  33.07 
 
 		 1799 aa  76.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  36.52 
 
 		 786 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  36.7 
 
 		 550 aa  75.5  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  37.04 
 
 		 777 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  40.77 
 
 		 1444 aa  72.8  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  33.77 
 
 		 966 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  36.46 
 
 		 1234 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.82 
 
 		 674 aa  72  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  35.88 
 
 		 470 aa  72  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  30.56 
 
 		 1015 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.71 
 
 		 945 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.4 
 
 		 581 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  46.25 
 
 		 627 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 2554 aa  70.1  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  38.95 
 
 		 1732 aa  70.1  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  40 
 
 		 1707 aa  68.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  32.52 
 
 		 930 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40.22 
 
 		 3295 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  35.24 
 
 		 798 aa  68.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  35.48 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  30.16 
 
 		 581 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  36.61 
 
 		 735 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  35.97 
 
 		 912 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  33.83 
 
 		 469 aa  66.6  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  28.46 
 
 		 526 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  35.14 
 
 		 855 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  32.79 
 
 		 801 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  40 
 
 		 955 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  41.3 
 
 		 1292 aa  65.1  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2956  hypothetical protein  25.3 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  35.78 
 
 		 1262 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  39.56 
 
 		 664 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  37.6 
 
 		 604 aa  62.4  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  35.85 
 
 		 954 aa  62  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  34.27 
 
 		 951 aa  61.6  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  34.23 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  32.26 
 
 		 501 aa  60.1  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  34.82 
 
 		 1035 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  34.92 
 
 		 1122 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  33.87 
 
 		 928 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  32.87 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  34.75 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>