184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7918 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  66.54 
 
 
547 aa  679    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  100 
 
 
535 aa  1083    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  56.02 
 
 
567 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  47.9 
 
 
548 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  53.26 
 
 
693 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  44.49 
 
 
558 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  42.12 
 
 
597 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  42.88 
 
 
568 aa  372  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  49.47 
 
 
541 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  46.95 
 
 
403 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  46.45 
 
 
408 aa  360  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  45.48 
 
 
408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  47.46 
 
 
471 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  41.46 
 
 
411 aa  343  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  46.44 
 
 
604 aa  342  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  44.42 
 
 
407 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  40.23 
 
 
574 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  46.28 
 
 
727 aa  333  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  42.78 
 
 
399 aa  317  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  45.14 
 
 
387 aa  306  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  35.53 
 
 
589 aa  279  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  41.3 
 
 
850 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  39.06 
 
 
413 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  36.15 
 
 
469 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  42.14 
 
 
320 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  32.7 
 
 
636 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 
535 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  31.96 
 
 
631 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  33.73 
 
 
535 aa  203  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  32.54 
 
 
658 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  35 
 
 
532 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  31.63 
 
 
677 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  34.16 
 
 
583 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  30.9 
 
 
640 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  35.87 
 
 
434 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  31.49 
 
 
533 aa  183  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.98 
 
 
737 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  51.58 
 
 
374 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  33.81 
 
 
441 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  60.48 
 
 
468 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  64 
 
 
500 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  63.33 
 
 
801 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  55.29 
 
 
469 aa  155  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  57.82 
 
 
492 aa  153  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  60 
 
 
498 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  50.98 
 
 
490 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  52.15 
 
 
493 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  62.9 
 
 
489 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  58.4 
 
 
472 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  63.2 
 
 
461 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  57.04 
 
 
801 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  43.18 
 
 
603 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  57.94 
 
 
451 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  60.32 
 
 
380 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.23 
 
 
445 aa  143  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  30.53 
 
 
612 aa  143  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  58.54 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  54.26 
 
 
368 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  30.61 
 
 
587 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  52 
 
 
497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  27.5 
 
 
450 aa  126  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  25.06 
 
 
433 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  26.71 
 
 
446 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  25.53 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  26.86 
 
 
442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  25.78 
 
 
445 aa  113  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  25.65 
 
 
427 aa  109  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  25 
 
 
440 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  37.7 
 
 
479 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.94 
 
 
435 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  24.09 
 
 
424 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  40.88 
 
 
709 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  41.18 
 
 
391 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  42.86 
 
 
803 aa  93.6  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  37.96 
 
 
516 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  25.6 
 
 
469 aa  91.7  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  38.37 
 
 
801 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  39.74 
 
 
1016 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  39.02 
 
 
492 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  33.77 
 
 
642 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  35.04 
 
 
824 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  40.65 
 
 
634 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  38.28 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  41.8 
 
 
373 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  41.41 
 
 
494 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.43 
 
 
531 aa  80.5  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35 
 
 
933 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.12 
 
 
627 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  34.71 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.3 
 
 
476 aa  77.8  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  38.78 
 
 
494 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  35.54 
 
 
1207 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.33 
 
 
488 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  33.33 
 
 
890 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.23 
 
 
756 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  37.59 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  38.4 
 
 
165 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  34.35 
 
 
465 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.5 
 
 
1072 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.97 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>