More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5616 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 1097 aa  2140    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  39.95 
 
 		 1100 aa  566  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  41.12 
 
 		 1087 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  39.41 
 
 		 1056 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  39.64 
 
 		 1058 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  40.17 
 
 		 1110 aa  536  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.44 
 
 		 1042 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  41.87 
 
 		 1058 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  39.02 
 
 		 1048 aa  512  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.66 
 
 		 1050 aa  506  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  39.71 
 
 		 1036 aa  496  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 1066 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  38.71 
 
 		 1072 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 1049 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.86 
 
 		 1093 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.21 
 
 		 1102 aa  477  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.7 
 
 		 1125 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  35.51 
 
 		 1092 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.62 
 
 		 1103 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  37.85 
 
 		 1060 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 1028 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 1043 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  36.28 
 
 		 1055 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  34.38 
 
 		 1017 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 1094 aa  416  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 1082 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 		 957 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  35.31 
 
 		 922 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  36.59 
 
 		 1005 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  38.25 
 
 		 969 aa  340  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  37.04 
 
 		 960 aa  340  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  37.4 
 
 		 1158 aa  333  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  32.67 
 
 		 1018 aa  331  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 952 aa  320  7e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  34.28 
 
 		 1005 aa  307  8.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  45.68 
 
 		 1186 aa  295  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  35.29 
 
 		 1064 aa  290  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  34.83 
 
 		 943 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  34.03 
 
 		 999 aa  278  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  34.11 
 
 		 1227 aa  273  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 781 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  33.53 
 
 		 824 aa  271  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  34.55 
 
 		 1131 aa  264  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  38.83 
 
 		 792 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 963 aa  255  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  33.72 
 
 		 1085 aa  254  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 		 886 aa  252  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 775 aa  251  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 1034 aa  251  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  32.1 
 
 		 1119 aa  249  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 882 aa  248  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 816 aa  244  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  32.34 
 
 		 840 aa  244  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  36.39 
 
 		 1100 aa  241  6.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  36.89 
 
 		 916 aa  240  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  34.14 
 
 		 941 aa  239  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  33.38 
 
 		 799 aa  238  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 1085 aa  237  9e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 980 aa  237  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  36.35 
 
 		 1076 aa  234  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  32.72 
 
 		 1060 aa  233  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 		 943 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  36.14 
 
 		 701 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 818 aa  223  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  34.83 
 
 		 777 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 901 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 1079 aa  222  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 1137 aa  220  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  38.19 
 
 		 755 aa  219  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 831 aa  218  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 1161 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  42.23 
 
 		 765 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 972 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 966 aa  213  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 814 aa  212  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 877 aa  211  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  37.44 
 
 		 887 aa  211  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 601 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 601 aa  207  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  36.97 
 
 		 601 aa  207  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 973 aa  207  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 393 aa  206  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 888 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  36.2 
 
 		 776 aa  204  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 1141 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  39.04 
 
 		 490 aa  199  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 812 aa  199  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 768 aa  198  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  29.64 
 
 		 1056 aa  198  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  38.05 
 
 		 827 aa  197  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 973 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  36.66 
 
 		 1014 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 591 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  33.4 
 
 		 921 aa  195  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  41.69 
 
 		 919 aa  195  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.83 
 
 		 760 aa  195  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 973 aa  195  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  33.55 
 
 		 780 aa  194  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 948 aa  194  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 1064 aa  194  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>