More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6566 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1160 aa  2368    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  50.52 
 
 		 1062 aa  1035    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  38.93 
 
 		 1028 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1155 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 1140 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 1043 aa  446  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1023 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1177 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 982 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1155 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1177 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1027 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1127 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 1119 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1122 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1129 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1114 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 986 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 1037 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1181 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 989 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1132 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  29.71 
 
 		 1035 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1109 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1077 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 		 996 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1062 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  27.72 
 
 		 1102 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 1014 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 999 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1117 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 1079 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1010 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1120 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1066 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1038 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1076 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 1154 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1086 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0537  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1024 aa  378  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 1026 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1034 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1006 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1017 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 1143 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1139 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  28.9 
 
 		 1019 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1161 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  29.23 
 
 		 1047 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1150 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1148 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 992 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1116 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  28.56 
 
 		 925 aa  366  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1060 aa  366  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1039 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1103 aa  364  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1071 aa  363  8e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1144 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1219 aa  361  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1012 aa  361  5e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1076 aa  360  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1075 aa  360  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1164 aa  359  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1138 aa  357  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 1076 aa  357  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 1050 aa  357  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1023 aa  357  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1051 aa  356  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  30.15 
 
 		 1066 aa  355  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1163 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1089 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  29.25 
 
 		 1024 aa  352  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1154 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1096 aa  352  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1146 aa  351  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1109 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 1177 aa  350  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 1028 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1113 aa  349  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1116 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  29.22 
 
 		 1002 aa  348  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1047 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 994 aa  348  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1037 aa  347  5e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 1189 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1070 aa  347  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1155 aa  347  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1042 aa  343  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1131 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1023 aa  342  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1052 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  28.44 
 
 		 1030 aa  342  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1006 aa  342  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 1130 aa  341  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 1139 aa  341  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1147 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 1036 aa  340  9e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1048 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1010 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>