101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5335 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5335  conjugal transfer protein TraF  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.490398 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5167  putative conjugal transfer protein  46.62 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2493  conjugal transfer protein traF  40.46 
 
 		 196 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.955009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0519  TraF peptidase  35.98 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1819  plasmid transfer protein TraF  39.19 
 
 		 192 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31080  putative conjugal transfer protein  41.52 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000439083  unclonable  1.40338e-22 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7735  putative conjugal transfer protein precursor  34.12 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.80898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1988  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  37.29 
 
 		 195 aa  98.2  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3556  conjugal transfer protein precursor  34.88 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2871  putative conjugal transfer protein precursor  32.91 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2356  conjugal transfer protein TraF  39.71 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2015  conjugal transfer protein TraF  38.41 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.494735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2090  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  38.3 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2622  conjugal transfer protein traF  38.85 
 
 		 199 aa  94.7  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3821  putative conjugal transfer protein precursor  32.75 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0756  putative conjugal transfer protein precursor  32.28 
 
 		 181 aa  94.4  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0454  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  39.33 
 
 		 195 aa  94.4  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4011  peptidase S26C conjugative transfer signal peptidase TraF  35 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3521  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  36.72 
 
 		 195 aa  93.6  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3845  TraF peptidase  32.75 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2624  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  36.16 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0317965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7435  putative conjugal transfer protein precursor  33.57 
 
 		 163 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1488  TraF peptidase  40.67 
 
 		 195 aa  91.3  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3727  conjugal transfer protein  37.99 
 
 		 203 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3685  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  35.17 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0585  conjugal transfer protein precursor  34.23 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.961115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1882  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  39.44 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.760081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1258  TraF peptidase  38 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2333  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  38.06 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2802  conjugal transfer protein precursor  34.62 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1292  TraF peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S26C  38.86 
 
 		 199 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2602  conjugal transfer TraF transmembrane protein  39.43 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3020  TraF peptidase  36.72 
 
 		 195 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2929  TraF peptidase  39.33 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.16718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2717  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  36.72 
 
 		 195 aa  88.6  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.378088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2658  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  36.63 
 
 		 199 aa  87.8  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0182  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  37.41 
 
 		 147 aa  87.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1510  conjugal transfer protein precursor  30.9 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1200  conjugal transfer protein precursor  33.1 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3535  conjugal transfer protein precursor  33.1 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35940  conjugative transfer signal peptidase TraF  37.58 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0136  hypothetical protein  30.23 
 
 		 310 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182837  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3373  conjugal transfer protein precursor  29.48 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.117002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1030  putative conjugal transfer protein TraF  33.33 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.201544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4170  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  36.36 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0849  conjugal transfer protein precursor  35.93 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0690  putative conjugal transfer TRAF transmembrane protein  38.25 
 
 		 203 aa  85.5  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3080  conjugal transfer protein precursor  31.79 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3349  putative conjugal transfer protein (traF)  35.29 
 
 		 171 aa  84.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236626  normal  0.920518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0978  putative conjugal transfer protein TraF  34.67 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0362  conjugal transfer protein precursor  37.93 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1267  TraF peptidase  36.3 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2250  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  37.06 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3011  conjugal transfer protein precursor  31.41 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3189  conjugal transfer protein precursor  31.17 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.110691  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1605  conjugal transfer protein precursor  33.33 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3183  conjugal transfer protein precursor  28.57 
 
 		 200 aa  80.9  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1721  putative conjugal transfer protein  31.9 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000828032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0706  conjugal transfer protein precursor  29.24 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3906  conjugal transfer protein precursor  30 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2333  TraF peptidase  30.26 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.530383  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2342  conjugal transfer protein precursor  32.43 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2247  conjugal transfer peptidase TraF  30.29 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0684  conjugal transfer protein precursor  29.07 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0628  putative conjugal transfer protein TraF  32.41 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0024  conjugal transfer peptidase TraF  28.32 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0928495  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4318  conjugal transfer peptidase TraF  30.52 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.666269  normal  0.975126 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2531  conjugal transfer protein TraF  31.88 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.400646  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9596  conjugal transfer pilin processing protease TraF  36.67 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5392  conjugal transfer pilin processing protease TraF  25.84 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4541  conjugal transfer pilin processing protease TraF  30.73 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.708935  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4714  conjugative transfer signal peptidase TraF  27.92 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  29.66 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1007  signal peptidase I  28.65 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.680167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1613  Peptidase S26, conserved region  28.81 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6524  conjugal transfer peptidase TraF  31.13 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897542  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  30.43 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6613  conjugal transfer peptidase TraF  31.13 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9191  conjugal transfer pilin processing protease TraF  28 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1172  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  22.76 
 
 		 155 aa  47.8  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1533  hypothetical protein  33.57 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1649  peptidase S26A, signal peptidase I  33.94 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.301306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  29.91 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8132  conjugal transfer pilin processing protease TraF  29.22 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.562058  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  29.91 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1617  signal peptidase I  25 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00286894  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  29.73 
 
 		 271 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1211  Signal peptidase I  25.53 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0257047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  28.78 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  29.2 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  29.2 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0878  hypothetical protein  20.67 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1111  signal peptidase I  28.69 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  29.09 
 
 		 220 aa  42  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0097  type IV conjugative transfer system signal peptidase  29.91 
 
 		 176 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.120482 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0276  Type IV secretory pathway protease TraF-like protein  28.26 
 
 		 196 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  24.55 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  26.09 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  25 
 
 		 206 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  29.67 
 
 		 272 aa  41.6  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.761462 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>