114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2088 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 244 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  43.86 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  44.1 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  42.54 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  44.68 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  43.48 
 
 		 275 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 271 aa  131  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  39.56 
 
 		 277 aa  131  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  29.09 
 
 		 1034 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  32.42 
 
 		 1158 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  33.2 
 
 		 1049 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  31.77 
 
 		 992 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.5 
 
 		 1339 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  31.55 
 
 		 1163 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  29.26 
 
 		 494 aa  62  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  28.17 
 
 		 1204 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 1050 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  33.88 
 
 		 1075 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 636 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.24 
 
 		 1139 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.84 
 
 		 1067 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 1005 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 952 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 1064 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  30.2 
 
 		 965 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 1190 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  25.38 
 
 		 1097 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 943 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  27.31 
 
 		 666 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  30.6 
 
 		 1093 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  33.74 
 
 		 1042 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  28.24 
 
 		 1092 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  27.06 
 
 		 1163 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  28.57 
 
 		 1145 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  29.69 
 
 		 496 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  26.74 
 
 		 1083 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  28.2 
 
 		 1108 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  28.86 
 
 		 867 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  22.78 
 
 		 365 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  24.58 
 
 		 1082 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 1097 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  29.29 
 
 		 1025 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  31.47 
 
 		 950 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 1193 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  29.58 
 
 		 1055 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  28.69 
 
 		 378 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 968 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 1043 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  28.92 
 
 		 990 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  27.73 
 
 		 1010 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  31.22 
 
 		 931 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  44.05 
 
 		 1055 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 963 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.67 
 
 		 1126 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  30.96 
 
 		 1141 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  24.7 
 
 		 1056 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  27.27 
 
 		 995 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 449 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.3 
 
 		 919 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3859  transcriptional regulator, SARP family  30.64 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4451  transcriptional regulator, SARP family  43.84 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  31.8 
 
 		 922 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  25.42 
 
 		 993 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  29.41 
 
 		 981 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  29.24 
 
 		 597 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  23.64 
 
 		 1095 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36 
 
 		 1003 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  24.9 
 
 		 981 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  26.83 
 
 		 930 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2437  transcriptional activator domain-containing protein  27.35 
 
 		 597 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0868593  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 423 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  37.96 
 
 		 1138 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.51 
 
 		 1121 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 1116 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.38 
 
 		 1148 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 602 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5071  SARP family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 296 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.33 
 
 		 921 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 1000 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  27.39 
 
 		 1102 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  30.47 
 
 		 1088 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  30 
 
 		 1089 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  28.23 
 
 		 1054 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  41.57 
 
 		 1058 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  36.08 
 
 		 379 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  25.3 
 
 		 1094 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  23.67 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  28.77 
 
 		 514 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  28.08 
 
 		 1733 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 654 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  30.62 
 
 		 526 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  27.6 
 
 		 1022 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.07 
 
 		 1017 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  31.3 
 
 		 1044 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  30.52 
 
 		 1186 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  30.52 
 
 		 1110 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  32.98 
 
 		 1066 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  29.69 
 
 		 1064 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  49.21 
 
 		 1036 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  28.12 
 
 		 1021 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>