More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2991 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  40.92 
 
 		 1083 aa  699    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  41.26 
 
 		 1175 aa  771    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  42.12 
 
 		 1202 aa  766    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1082 aa  2204    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  42.1 
 
 		 1189 aa  760    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  50.51 
 
 		 1064 aa  1015    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  40.39 
 
 		 1096 aa  730    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  39.62 
 
 		 1060 aa  726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  41.99 
 
 		 1084 aa  771    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  51.08 
 
 		 1085 aa  1066    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  39.51 
 
 		 1077 aa  704    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  45.4 
 
 		 1062 aa  948    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 1026 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 		 1047 aa  585  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.19 
 
 		 1177 aa  582  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1114 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 1012 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.54 
 
 		 1023 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.09 
 
 		 1161 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.69 
 
 		 1066 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1155 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 1055 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  36.24 
 
 		 1164 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 1037 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1036 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 1029 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.1 
 
 		 1034 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 1020 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 1177 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1124 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.59 
 
 		 1008 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  33.54 
 
 		 1043 aa  521  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1097 aa  521  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  35.49 
 
 		 1052 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 1128 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 1038 aa  515  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1010 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 1049 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 1050 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 1033 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1181 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 1026 aa  509  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 1128 aa  502  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1006 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1079 aa  493  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1117 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1006 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1017 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.69 
 
 		 1063 aa  489  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1192 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 1038 aa  489  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1132 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1173 aa  483  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 1071 aa  482  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1161 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1116 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1148 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1127 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1027 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1075 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.64 
 
 		 1002 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 994 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 1071 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  33.63 
 
 		 1119 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 996 aa  472  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1138 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1039 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1139 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  32.36 
 
 		 1039 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1051 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 1041 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1116 aa  466  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.07 
 
 		 1028 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 1034 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1020 aa  460  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1147 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 1025 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 1130 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1179 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  33.24 
 
 		 1041 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1051 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  31.71 
 
 		 1036 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 1081 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1071 aa  455  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 1014 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1023 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1129 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 996 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1103 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 979 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1065 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  32.34 
 
 		 1130 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 		 1023 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 1019 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1034 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1168 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1010 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1076 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1023 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1122 aa  443  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>