More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3484 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4516  ferric vibriobactin receptor  81.61 
 
 		 685 aa  1159    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3484  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 685 aa  1393    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0621  TonB-dependent receptor  67.78 
 
 		 686 aa  986    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.119281  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2167  TonB-dependent receptor  98.98 
 
 		 685 aa  1379    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00521843  hitchhiker  0.00163603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3727  TonB-dependent receptor  80.58 
 
 		 685 aa  1167    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.36729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3798  TonB-dependent receptor  80.88 
 
 		 685 aa  1143    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0330  TonB-dependent receptor  82.63 
 
 		 685 aa  1169    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3923  TonB-dependent receptor  81.17 
 
 		 685 aa  1145    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0343  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 686 aa  301  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.926534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0977  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 707 aa  260  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.138127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1803  ferric vibriobactin receptor  29.12 
 
 		 687 aa  260  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 692 aa  254  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 694 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 719 aa  233  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3671  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 705 aa  227  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 711 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3345  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 705 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10200  putative TonB-dependent receptor protein  28.69 
 
 		 694 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.965249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3472  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 705 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.280502  normal  0.0143409 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 694 aa  220  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3147  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 711 aa  219  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.116125  hitchhiker  0.00000946048 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4087  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 694 aa  219  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 712 aa  209  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 686 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 835 aa  164  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 700 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 695 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 764 aa  133  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 713 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 794 aa  121  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 690 aa  122  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 747 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 730 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  22.87 
 
 		 737 aa  118  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  34.17 
 
 		 776 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 702 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 732 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 779 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 732 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 728 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 713 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 695 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 697 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 730 aa  110  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 802 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 720 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 726 aa  108  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 757 aa  107  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 758 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 733 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 736 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 712 aa  107  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 703 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 704 aa  103  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  23.61 
 
 		 739 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 780 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  23.86 
 
 		 714 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 687 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 729 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 851 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 710 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 853 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  23.92 
 
 		 666 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 758 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 749 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 670 aa  97.8  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 743 aa  97.4  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 783 aa  96.3  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 738 aa  95.5  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 758 aa  95.1  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  23.21 
 
 		 755 aa  95.1  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 687 aa  95.1  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 688 aa  94.4  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 694 aa  94.4  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 896 aa  94  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 696 aa  94  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 728 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 729 aa  93.2  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  22.02 
 
 		 641 aa  92.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 784 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 		 771 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 771 aa  92.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 718 aa  91.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  21.39 
 
 		 773 aa  90.9  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 710 aa  90.5  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  22.93 
 
 		 715 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  23.13 
 
 		 748 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 763 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 722 aa  88.2  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 753 aa  88.6  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 773 aa  88.6  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 815 aa  87  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  24.23 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  24.23 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  24.23 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  24.23 
 
 		 663 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 775 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  21.82 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>