More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4812 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  47.69 
 
 		 1029 aa  969    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  46.84 
 
 		 1027 aa  905    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  46.21 
 
 		 1109 aa  871    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1018 aa  2073    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  35.56 
 
 		 1006 aa  549  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1036 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1094 aa  525  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 1123 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1130 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1056 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1145 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 1081 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1033 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 913 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 1045 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 1033 aa  436  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1176 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1062 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 1056 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  32.13 
 
 		 1046 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1079 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 953 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 1061 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 1025 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1095 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 1144 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1068 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1148 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1086 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1056 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 937 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1038 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1086 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1047 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1043 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 1128 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1146 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 1031 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1127 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1168 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1181 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1020 aa  352  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1036 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 929 aa  349  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1026 aa  349  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1128 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1161 aa  346  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1164 aa  341  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 1026 aa  340  5.9999999999999996e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1148 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1138 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 1049 aa  330  7e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1024 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 1130 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 1065 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1152 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1139 aa  322  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1038 aa  320  7.999999999999999e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1155 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 1050 aa  318  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1060 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1013 aa  317  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1154 aa  316  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 1020 aa  317  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1163 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  28.77 
 
 		 1074 aa  314  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1019 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 		 1128 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1131 aa  310  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 1079 aa  310  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 1029 aa  308  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1117 aa  307  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1217 aa  307  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1036 aa  306  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1173 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1004 aa  306  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 1038 aa  306  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 1037 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1116 aa  304  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1177 aa  302  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 1019 aa  301  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1188 aa  301  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1066 aa  301  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1142 aa  301  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 994 aa  301  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1036 aa  298  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 1000 aa  297  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1014 aa  296  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1202 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.45 
 
 		 1041 aa  295  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 1164 aa  294  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1132 aa  294  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1097 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1048 aa  292  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  26.65 
 
 		 1058 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1055 aa  291  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1040 aa  291  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1177 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1039 aa  290  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1085 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>